More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5118 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
837 aa  1683  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.07 
 
 
979 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  32.14 
 
 
816 aa  343  8e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.3 
 
 
975 aa  338  2e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  32 
 
 
816 aa  337  4e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.23 
 
 
1301 aa  322  2e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.7 
 
 
963 aa  313  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
978 aa  305  3e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.73 
 
 
1152 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
1013 aa  259  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
1002 aa  254  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 
1010 aa  246  1e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
1358 aa  244  4e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  31.41 
 
 
1347 aa  218  3e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
1048 aa  214  4e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
1180 aa  214  8e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  31.44 
 
 
1400 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.11 
 
 
1335 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  31.24 
 
 
1366 aa  208  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  30.04 
 
 
1306 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  33.47 
 
 
1172 aa  205  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1426 aa  205  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
1645 aa  205  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  31.65 
 
 
1378 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
1131 aa  204  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 
677 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  33.48 
 
 
1427 aa  200  1e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  30.12 
 
 
961 aa  199  1e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 
904 aa  199  1e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  32.71 
 
 
1156 aa  200  1e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  28.05 
 
 
1373 aa  199  2e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
1383 aa  199  2e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
1003 aa  197  5e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
1431 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
1385 aa  195  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  30.86 
 
 
1378 aa  195  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  29.84 
 
 
934 aa  194  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  33.84 
 
 
919 aa  194  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1711 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  29.27 
 
 
1311 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  30.86 
 
 
1374 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1361 aa  193  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 
1341 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  29.95 
 
 
1344 aa  192  3e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  31.53 
 
 
1355 aa  191  4e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 
1140 aa  191  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  25.05 
 
 
1384 aa  191  6e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 
1631 aa  191  6e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
1153 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  1.7622e-06 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  27.97 
 
 
1344 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 
1691 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1651 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
823 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  26.41 
 
 
863 aa  187  5e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  29.56 
 
 
1343 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
1299 aa  187  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  32.86 
 
 
1298 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 
1415 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  30.57 
 
 
1418 aa  186  1e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  29.56 
 
 
1355 aa  185  2e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  29.4 
 
 
1363 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1390 aa  184  8e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  28.57 
 
 
1374 aa  183  9e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
1406 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  27.31 
 
 
1366 aa  183  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
1646 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  33.67 
 
 
876 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1390 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1390 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
1118 aa  181  5e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
1370 aa  180  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.4 
 
 
1514 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1559 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.19 
 
 
1514 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
468 aa  178  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  29.63 
 
 
1370 aa  178  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
532 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  31.86 
 
 
1296 aa  177  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  29 
 
 
993 aa  176  1e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1031  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1131 aa  176  2e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.768055  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.76 
 
 
1202 aa  174  4e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.66 
 
 
1324 aa  174  6e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 
940 aa  173  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.28 
 
 
1396 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  26.61 
 
 
1334 aa  171  5e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1274 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
1248 aa  170  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.01 
 
 
1051 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
668 aa  168  3e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  28.57 
 
 
663 aa  168  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
1287 aa  168  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1195 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
1853 aa  167  1e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  28.67 
 
 
1278 aa  166  2e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  29.17 
 
 
1130 aa  166  2e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
404 aa  166  2e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
1323 aa  165  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 
657 aa  164  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  27.41 
 
 
1397 aa  164  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  5.41195e-05 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 
721 aa  164  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703753 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>