More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4996 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
462 aa  920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.22 
 
 
462 aa  588  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.29 
 
 
460 aa  579  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.61 
 
 
459 aa  543  1e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.55 
 
 
469 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 
581 aa  528  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.78 
 
 
463 aa  528  1e-149  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.06 
 
 
467 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.28 
 
 
467 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.75 
 
 
467 aa  515  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.81 
 
 
468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 
467 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.84 
 
 
467 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.77 
 
 
467 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.02 
 
 
468 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.42 
 
 
467 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
468 aa  512  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.32 
 
 
480 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.47 
 
 
463 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
468 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.1 
 
 
467 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.2 
 
 
467 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.2 
 
 
466 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
467 aa  502  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.6 
 
 
467 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.34 
 
 
466 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.04 
 
 
471 aa  494  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.51 
 
 
467 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.51 
 
 
467 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.91 
 
 
466 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.86 
 
 
470 aa  491  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 
470 aa  488  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.94 
 
 
468 aa  478  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.18 
 
 
468 aa  473  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.94 
 
 
462 aa  471  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.14 
 
 
475 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  53.32 
 
 
500 aa  474  1e-132  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.72 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.27 
 
 
468 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.19 
 
 
462 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
472 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.22 
 
 
470 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.48 
 
 
474 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  53.21 
 
 
466 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.08 
 
 
475 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.11 
 
 
468 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  53.1 
 
 
472 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  54.18 
 
 
464 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.92 
 
 
464 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.99 
 
 
477 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.15 
 
 
473 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 
481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.52 
 
 
483 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 
476 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.23 
 
 
462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.83 
 
 
475 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 
476 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.35 
 
 
466 aa  449  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.86 
 
 
471 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
476 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 
476 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.8 
 
 
468 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.14 
 
 
466 aa  450  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.33 
 
 
476 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.26 
 
 
476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.26 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 
476 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.46 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 
598 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.1 
 
 
475 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.92 
 
 
476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.27 
 
 
477 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.31 
 
 
476 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
496 aa  442  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.91 
 
 
475 aa  444  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
476 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  52 
 
 
465 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.71 
 
 
476 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.49 
 
 
467 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.53 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.49 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.61 
 
 
466 aa  439  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.53 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 
467 aa  438  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.32 
 
 
478 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.17 
 
 
480 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 
478 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.94 
 
 
489 aa  437  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 
478 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
478 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
478 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>