More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4865 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
211 aa  182  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  47.29 
 
 
241 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  45.5 
 
 
222 aa  159  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  46.5 
 
 
227 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  43.63 
 
 
234 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  44.28 
 
 
215 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
224 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30 
 
 
390 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  25.95 
 
 
201 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
196 aa  74.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  36.48 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.47 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  33.16 
 
 
208 aa  68.6  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  31.34 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  23.38 
 
 
210 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.76 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4190  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.278739  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  35.42 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  31.37 
 
 
311 aa  65.5  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.7 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.01 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
291 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
305 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.39 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 
264 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  36.54 
 
 
310 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  31.43 
 
 
311 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  28.25 
 
 
200 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  30 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.04 
 
 
244 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
205 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
225 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
415 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.84 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 
197 aa  61.6  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2346  putative methyltransferase protein  43.75 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.781761  normal  0.183128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 
231 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  32.61 
 
 
309 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  32.69 
 
 
311 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  27.84 
 
 
296 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.41 
 
 
541 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.57 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  29.48 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 
201 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.19 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 
222 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.56 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  37.96 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.31 
 
 
243 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 
252 aa  59.7  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 
208 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.78 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.81 
 
 
233 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.33 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.71 
 
 
238 aa  58.9  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.1 
 
 
200 aa  58.5  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  28.76 
 
 
541 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40 
 
 
222 aa  58.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
266 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  28.76 
 
 
541 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.79 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  36.11 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
250 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  28.03 
 
 
541 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  37.04 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.66 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  28.76 
 
 
541 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  36.42 
 
 
272 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
212 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
219 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.59 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  36.75 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.93 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>