277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4714 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  86.02 
 
 
276 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  72.06 
 
 
306 aa  323  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  61.39 
 
 
296 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.33 
 
 
671 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
671 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  37.33 
 
 
671 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 
664 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  42.53 
 
 
349 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  41.67 
 
 
348 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
349 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 
335 aa  112  8.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 
354 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.8 
 
 
276 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.49 
 
 
270 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.27 
 
 
339 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
288 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  38.5 
 
 
876 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  29.31 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.7 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.38 
 
 
224 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.19 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 
299 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  34.42 
 
 
624 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
248 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  28.1 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
210 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.36 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  37.67 
 
 
600 aa  73.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  35.62 
 
 
616 aa  73.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  26.22 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  24.5 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  31.91 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.8 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 
212 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 
268 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  31.74 
 
 
617 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.04 
 
 
553 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  32.19 
 
 
617 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  31.36 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.87 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  27.21 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 
236 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  29.31 
 
 
221 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.8 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.44 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.44 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  28.4 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  31.95 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  23.23 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  31.97 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
204 aa  65.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  25.39 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  27.51 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  30.93 
 
 
630 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  23.64 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 
172 aa  63.2  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
229 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  27.7 
 
 
182 aa  62.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.68 
 
 
652 aa  62.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  25.14 
 
 
197 aa  62.4  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
220 aa  62  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>