More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4707 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
289 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  37.79 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  36.49 
 
 
300 aa  152  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 
296 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 
296 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
305 aa  149  7e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
340 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  36.55 
 
 
305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  36.24 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  37.12 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  35.91 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  36.24 
 
 
296 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  36.07 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  37.33 
 
 
299 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
300 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  37.42 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  35.52 
 
 
311 aa  138  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
289 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
295 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
289 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  34.8 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
294 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
313 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
311 aa  132  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
343 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  34.81 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  36.18 
 
 
325 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.55 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 
327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 
307 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 
309 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
309 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
290 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
289 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.47 
 
 
2762 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
339 aa  112  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  29.74 
 
 
289 aa  106  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
315 aa  99.4  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  33.08 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.83 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.73 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  27.78 
 
 
284 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
292 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  26.33 
 
 
282 aa  89.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.98 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
288 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
288 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  27.48 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
288 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  33.02 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  32.56 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  33.48 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  33.64 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  33.19 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.48 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
360 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
308 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 
275 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  33.94 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1609  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  31.63 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  28.76 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 
287 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  29.6 
 
 
308 aa  76.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  28.7 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 
297 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.23 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  28.38 
 
 
298 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0255  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  38.83 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 
291 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 
285 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>