More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4705 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  49.65 
 
 
286 aa  250  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  50.18 
 
 
280 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  49.45 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  48.74 
 
 
277 aa  241  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  49.45 
 
 
279 aa  236  3e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0831  spermidine synthase  42.49 
 
 
280 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1825  spermidine synthase  42.49 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  41.42 
 
 
277 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  42.81 
 
 
277 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0896  spermidine synthase  40.59 
 
 
279 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1086  spermidine synthase  41.76 
 
 
280 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  43.45 
 
 
275 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  38.55 
 
 
279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3351  spermidine synthase  39.93 
 
 
275 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000337487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  37.41 
 
 
283 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  37.27 
 
 
283 aa  203  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  37.69 
 
 
275 aa  202  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3461  spermidine synthase  39.55 
 
 
278 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  37.94 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  36.16 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0073  spermidine synthase  45.16 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.116459  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  37.59 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0119  spermidine synthase  42.65 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2794  spermidine synthase  42.32 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  36.06 
 
 
283 aa  199  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  39.02 
 
 
288 aa  199  5e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2411  spermidine synthase  43.59 
 
 
278 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  38.68 
 
 
288 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3567  spermidine synthase  43.32 
 
 
275 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  39.76 
 
 
276 aa  198  9e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  42.18 
 
 
307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  38.95 
 
 
273 aa  196  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0335  spermidine synthase  44.8 
 
 
278 aa  196  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.404656 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  38.46 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  38.46 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  38.46 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1816  spermidine synthase  41.39 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.150426  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  35.32 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  38.46 
 
 
286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  37.89 
 
 
286 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  45.82 
 
 
316 aa  195  7e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  41.84 
 
 
283 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  38.25 
 
 
289 aa  193  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5164  spermidine synthase  37.83 
 
 
275 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2046  spermidine synthase  41.39 
 
 
285 aa  192  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  39.49 
 
 
281 aa  192  6e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5462  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5500  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0570  spermidine synthase  38.25 
 
 
302 aa  191  8e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.758892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5219  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5051  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5492  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5619  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5548  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5458  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5067  spermidine synthase  37.45 
 
 
275 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.694497  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21581  spermidine synthase  39.48 
 
 
288 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  35.19 
 
 
283 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1314  spermidine synthase  39.33 
 
 
278 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3884  spermidine synthase  37.08 
 
 
275 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1286  spermidine synthase  38.89 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  36.14 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  36.14 
 
 
296 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  36.14 
 
 
296 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03650  spermidine synthase  38.57 
 
 
285 aa  187  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18161  spermidine synthase  39.29 
 
 
290 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4087  spermidine synthase  40.21 
 
 
296 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  37.5 
 
 
287 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  36.17 
 
 
287 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  37.23 
 
 
292 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1199  spermidine synthase  35.23 
 
 
279 aa  186  5e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.928058  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  36.43 
 
 
287 aa  181  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  40.07 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  40.33 
 
 
290 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0558  spermidine synthase  40.51 
 
 
284 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.587029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3123  spermidine synthase  37.73 
 
 
283 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0201  spermidine synthase  39.19 
 
 
283 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.386649 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  39.36 
 
 
287 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3769  spermidine synthase  38.3 
 
 
283 aa  179  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18761  spermidine synthase  38.01 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0918674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  40.51 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  41.2 
 
 
320 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  36.17 
 
 
287 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1326  spermidine synthase  39.37 
 
 
295 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  40.85 
 
 
320 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  40.87 
 
 
291 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  36.05 
 
 
300 aa  176  3e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  37.86 
 
 
286 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  35.71 
 
 
288 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  35.94 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  36.06 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  42.32 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.862336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>