More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4504 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4504  ribosomal protein S6  100 
 
 		 210 aa  408  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0118  SSU ribosomal protein S6P  40 
 
 		 148 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0125  ribosomal protein S6  40 
 
 		 148 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0136  ribosomal protein S6  40 
 
 		 148 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0122  ribosomal protein S6  40 
 
 		 150 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.302975  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2764  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1476  30S ribosomal protein S6  38.24 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100588 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0600  ribosomal protein S6  40.43 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  40.66 
 
 		 95 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3188  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.514903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4893  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4806  ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 176 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18971  30S ribosomal protein S6  31.61 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2072  30S ribosomal protein S6  40.45 
 
 		 108 aa  75.1  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.994303  hitchhiker  0.00328308 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19161  30S ribosomal protein S6  37.62 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  36.08 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1350  30S ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1799  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 152 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3887  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311083  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1094  ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.380454  normal  0.02861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3815  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.247483  normal  0.0901852 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1682  ribosomal protein S6  38.64 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18431  30S ribosomal protein S6  39.39 
 
 		 172 aa  71.2  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.800944 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2916  ribosomal protein S6  38.2 
 
 		 96 aa  70.9  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000156289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3487  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  39.78 
 
 		 95 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0742  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.035409  normal  0.774483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1691  30S ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0713  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2464  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2607  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00172521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1383  ribosomal protein S6  34.41 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.760847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2985  30S ribosomal protein S6  31.87 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.620365 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  35.48 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  28.93 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2844  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 118 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000534713  hitchhiker  0.0000000000000955305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2296  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 168 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.220775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0010  30S ribosomal protein S6  28.32 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.490507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21891  30S ribosomal protein S6  36.45 
 
 		 138 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18971  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 155 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0220  ribosomal protein S6  29.51 
 
 		 156 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1999  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0575699  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 125 aa  67  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2024  30S ribosomal protein S6  35.05 
 
 		 102 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.359562  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  36.26 
 
 		 95 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0758  30S ribosomal protein S6  35.87 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000104725  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2030  30S ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 101 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5229  30S ribosomal protein S6  34.75 
 
 		 120 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2355  30S ribosomal protein S6  30.77 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2009  30S ribosomal protein S6  34.29 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.950634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0794  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00576366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0774  30S ribosomal protein S6  32.14 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000163074  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0595  30S ribosomal protein S6  33.03 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1818  30S ribosomal protein S6  33.9 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.195181  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0741  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  0.125363 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1326  SSU ribosomal protein S6P  34 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24985  normal  0.887492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2038  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  31.62 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3784  30S ribosomal protein S6  30.36 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3639  30S ribosomal protein S6  30.36 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0683  30S ribosomal protein S6  30.36 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3037  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00243043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1666  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  31.9 
 
 		 122 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1316  30S ribosomal protein S6  34.4 
 
 		 138 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2105  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  64.3  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0494  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 136 aa  64.7  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0446  30S ribosomal protein S6  29.63 
 
 		 132 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453306 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2052  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1216  30S ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 127 aa  63.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.402535 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2306  30S ribosomal protein S6  34.17 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1520  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162884  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  39.56 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  34.07 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0898  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0179425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002332  SSU ribosomal protein S6p  36.46 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.257781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  35.16 
 
 		 95 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0981  ribosomal protein S6  33.91 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2824  30S ribosomal protein S6  26.8 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.254018  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2446  30S ribosomal protein S6  26.8 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0045402 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2133  30S ribosomal protein S6  32.26 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.226778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1526  30S ribosomal protein S6  35.35 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153289  normal  0.214349 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2395  30S ribosomal protein S6  34.34 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2590  30S ribosomal protein S6  33.68 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  32.97 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1131  30S ribosomal protein S6  33.7 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.999974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>