246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4494 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4494  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  100 
 
 
153 aa  322  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.093103  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  71.13 
 
 
164 aa  220  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0205474  normal  0.015389 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2401  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.42 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0510253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1552  zinc-binding CMP/dCMP deaminase  70.42 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2313  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  70.42 
 
 
164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0202  deoxycytidylate deaminase  47.97 
 
 
162 aa  149  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.131565 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0459  deoxycytidylate deaminase  49.65 
 
 
158 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0433  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 
148 aa  143  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0827  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.33 
 
 
174 aa  134  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1747  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.31 
 
 
156 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0753156  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1647  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  50 
 
 
157 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.318126  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1156  comE operon protein 2  46.38 
 
 
153 aa  133  9e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.403375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0828  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.67 
 
 
174 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0644  ComE operon protein 2  50 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000470948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1704  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.31 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.677481  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2185  dCMP deaminase  48.28 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1716  late competence protein required for DNA binding and uptake  49.15 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000612083  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.71 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0622  deoxycytidylate deaminase, putative  48.61 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.646191  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1624  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.64 
 
 
174 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.526387  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0726  deoxycytidylate deaminase, putative  47.92 
 
 
187 aa  130  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.837477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1686  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.61 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0100  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.65 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1891  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.22 
 
 
177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1622  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  47.92 
 
 
154 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000389213  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2450  ComE operon protein 2  47.83 
 
 
151 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0169534  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0194  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.77 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4407  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4224  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4062  comE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0691295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4552  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.252932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4459  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000252157  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2193  deoxycytidylate deaminase, putative  46.36 
 
 
165 aa  127  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.494514  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4348  ComE operon protein 2  45.32 
 
 
185 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000304329 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0634  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.81 
 
 
148 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2599  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.33 
 
 
153 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.736828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1037  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.26 
 
 
152 aa  126  9.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0424018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4072  ComE operon protein 2  45.07 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0791  ComE operon protein 2  44.6 
 
 
185 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  0.000000127363 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4446  ComE operon protein 2  44.6 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.028939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1001  ComE operon protein 2  47.52 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0853  dCMP deaminase  46.1 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3052  ComE operon protein 2  44.6 
 
 
185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.901586  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2389  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.72 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0382435 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1618  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.41 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4177  ComE operon protein 2  43.88 
 
 
185 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1598  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 
155 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000104146  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1646  ComE operon protein 2  48.46 
 
 
143 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.772371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1681  ComE operon protein 2  48.46 
 
 
143 aa  124  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000220754  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3026  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.67 
 
 
151 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.415381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1224  dCMP deaminase  44.67 
 
 
151 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.242587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4824  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.26 
 
 
155 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1252  deoxycytidylate deaminase  49.31 
 
 
146 aa  123  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0080548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1443  deoxycytidylate deaminase  45.14 
 
 
158 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0261  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.9 
 
 
145 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00013435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21480  deoxycytidylate deaminase  42.76 
 
 
156 aa  121  4e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3161  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.1 
 
 
147 aa  120  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0257  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.08 
 
 
144 aa  120  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0348  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.78 
 
 
161 aa  120  8e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0042  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.54 
 
 
170 aa  119  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00633059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4176  ComE operon protein 2  48.74 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000229271  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1985  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.15 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000230584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.37 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.508443  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1766  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.43 
 
 
170 aa  115  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2081  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.76 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000136796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2391  putative ComE operon protein 2  42.76 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0530  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.37 
 
 
169 aa  114  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0866803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0516  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
169 aa  114  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000285737  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.41 
 
 
169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.238566  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1419  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.82 
 
 
153 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0399371  normal  0.378339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2856  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0063  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.89 
 
 
153 aa  110  9e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3096  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0408769 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1943  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.96 
 
 
149 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1376  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.67 
 
 
146 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2433  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  39.46 
 
 
155 aa  103  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_356  cytidine/deoxycytidylate deaminase, Zn-binding protein  40.54 
 
 
157 aa  102  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0152459  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0413  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.54 
 
 
157 aa  102  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.142884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0392  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.86 
 
 
157 aa  101  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.65946  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1855  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.33 
 
 
176 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1393  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.58 
 
 
167 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0712  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.73 
 
 
185 aa  99.8  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0530  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.06 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1248  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.62 
 
 
170 aa  97.1  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.639553  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04005  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.84 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3632  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.19 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1242  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.57 
 
 
179 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0147  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.38 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000260074  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34441  deoxycytidylate deaminase  33.12 
 
 
341 aa  92.4  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0952024  normal  0.762426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2084  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.93 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0294047  normal  0.214354 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00950  dCMP deaminase, putative  33.33 
 
 
273 aa  89.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.41296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1927  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.84 
 
 
186 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2215  cytidine/deoxycytidylate deaminase (dCMP deaminase)  37.5 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5014  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.45 
 
 
194 aa  88.2  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1340  hypothetical protein  38.52 
 
 
160 aa  87.4  6e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1174  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.26 
 
 
168 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0947  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.75 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.244959 
 
 
-
 
NC_002950  PG1856  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.94 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0992  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.52 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>