More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4493 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 180 aa  360  5.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  38.15 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  35.85 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  36.57 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  37.06 
 
 		 157 aa  97.8  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 164 aa  94.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  33.52 
 
 		 162 aa  94.4  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 		 161 aa  94  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  32.18 
 
 		 174 aa  92.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  34.38 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  30.46 
 
 		 178 aa  91.3  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  34.05 
 
 		 178 aa  90.9  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 		 235 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  40.34 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 		 202 aa  88.6  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  36.36 
 
 		 159 aa  87.8  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  36.42 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  35.39 
 
 		 164 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 174 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  33.97 
 
 		 167 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 172 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 169 aa  84.7  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 167 aa  84.3  9e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  36.67 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  36.25 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  31.06 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  31.55 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3203  lipoprotein signal peptidase  39.19 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  34.42 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  30.52 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  36.59 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  31.55 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  42.11 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  34.21 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  34.67 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  33.12 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  33.75 
 
 		 154 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  34.01 
 
 		 166 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  38.24 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2207  lipoprotein signal peptidase  41.59 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 158 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  36.07 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  29.55 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1277  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0128808  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0434  lipoprotein signal peptidase  32.45 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  35.66 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  33.14 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4211  lipoprotein signal peptidase  41.44 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4860  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.777227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 163 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.94 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.06 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2580  lipoprotein signal peptidase  35.58 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  31.29 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  34 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  30.99 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  32.67 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  32.18 
 
 		 172 aa  74.3  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4037  lipoprotein signal peptidase  34.57 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  35.19 
 
 		 207 aa  74.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>