More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4387 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.51 
 
 		 1034 aa  824    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  48.63 
 
 		 1023 aa  889    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  45.93 
 
 		 1039 aa  865    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.73 
 
 		 1039 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.88 
 
 		 1049 aa  690    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  41.46 
 
 		 1039 aa  707    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  43.15 
 
 		 1043 aa  688    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.4 
 
 		 1048 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.7 
 
 		 1039 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  40.04 
 
 		 1066 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  38.58 
 
 		 1071 aa  698    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.87 
 
 		 1066 aa  680    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.42 
 
 		 1039 aa  705    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1030 aa  1955    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  40.62 
 
 		 1039 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.82 
 
 		 1092 aa  748    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  40.15 
 
 		 1036 aa  640    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  44.69 
 
 		 1066 aa  696    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  44.33 
 
 		 1034 aa  786    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.98 
 
 		 1026 aa  787    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  50.15 
 
 		 1041 aa  926    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  43.77 
 
 		 1043 aa  735    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.43 
 
 		 1061 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.7 
 
 		 1039 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.84 
 
 		 1037 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.71 
 
 		 1049 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.93 
 
 		 1054 aa  749    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.86 
 
 		 1048 aa  705    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.49 
 
 		 1037 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.63 
 
 		 1053 aa  750    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  54.54 
 
 		 1045 aa  975    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  44.8 
 
 		 1058 aa  697    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  43.57 
 
 		 1049 aa  681    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  44.18 
 
 		 1058 aa  688    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  44.79 
 
 		 1047 aa  764    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  41.85 
 
 		 1075 aa  670    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.91 
 
 		 1039 aa  717    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  37.83 
 
 		 1052 aa  677    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.57 
 
 		 1049 aa  706    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  46.95 
 
 		 1040 aa  805    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  42.28 
 
 		 1039 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  43.09 
 
 		 1047 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  43.82 
 
 		 1043 aa  713    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  43.85 
 
 		 1031 aa  709    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  41.13 
 
 		 1052 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  39.73 
 
 		 1032 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.08 
 
 		 1028 aa  602  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1046 aa  601  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.24 
 
 		 1029 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  37.68 
 
 		 1039 aa  549  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  34.97 
 
 		 1046 aa  545  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.39 
 
 		 1033 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.3 
 
 		 1049 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  39.3 
 
 		 1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.1 
 
 		 1051 aa  539  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.97 
 
 		 1043 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.87 
 
 		 1034 aa  536  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.52 
 
 		 1459 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.4 
 
 		 1052 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  32.92 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.54 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  33.3 
 
 		 1052 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.29 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.92 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 		 1070 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  32.92 
 
 		 1053 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.65 
 
 		 1034 aa  526  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  34.1 
 
 		 1070 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 		 1054 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  39.9 
 
 		 1064 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  32.83 
 
 		 1053 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  39.71 
 
 		 1064 aa  529  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.44 
 
 		 1070 aa  528  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.42 
 
 		 1064 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  32.72 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  39.75 
 
 		 1064 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.92 
 
 		 1034 aa  522  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  32.82 
 
 		 1034 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.59 
 
 		 1066 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.01 
 
 		 1034 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.73 
 
 		 1077 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.73 
 
 		 1077 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  33.05 
 
 		 1047 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.73 
 
 		 1077 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.4 
 
 		 1462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  33.64 
 
 		 1083 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 		 1077 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.81 
 
 		 1069 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.18 
 
 		 1075 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1480 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  32.18 
 
 		 1044 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.21 
 
 		 1049 aa  515  1e-144  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 		 1077 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.54 
 
 		 1077 aa  513  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  34.62 
 
 		 1062 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.96 
 
 		 1063 aa  510  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  32.25 
 
 		 1053 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.45 
 
 		 1077 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.02 
 
 		 1077 aa  510  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.32 
 
 		 1082 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>