18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4312 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4312  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 
349 aa  656    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1595  cell surface protein  26.55 
 
 
270 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1646  hypothetical protein  26.55 
 
 
270 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000626927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1777  hypothetical protein  26.55 
 
 
270 aa  60.1  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.617262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1827  hypothetical protein  26.55 
 
 
270 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1625  cell surface protein  26.79 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000608951  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1645  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 
270 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0291  hypothetical protein  31.48 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.497447  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1850  hypothetical protein  24.17 
 
 
270 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00976816  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1903  hypothetical protein  25.89 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000423406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3553  hypothetical protein  25.66 
 
 
270 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.444632  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1791  hypothetical protein  24.78 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00308  peptidase M56, BlaR1  25.95 
 
 
314 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  27.61 
 
 
379 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  31.43 
 
 
324 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  29.31 
 
 
671 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3998  peptidase M56, BlaR1  24.66 
 
 
326 aa  43.9  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4390  peptidase M56 BlaR1  38.58 
 
 
321 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.431329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>