270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4304 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 131 aa  263  5.999999999999999e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  66.39 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  50.41 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  51.24 
 
 		 199 aa  99.4  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  51.22 
 
 		 147 aa  94  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  45.93 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  48.57 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 79 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 79 aa  67  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  49.28 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 70 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 122 aa  51.2  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6604  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.608837  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 255 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.84 
 
 		 255 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 252 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  36.36 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1812  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.330526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  48.08 
 
 		 117 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0336  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.000000000838003  normal  0.0169736 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.33 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  40.74 
 
 		 383 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.2 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2429  XRE family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.214939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  41.27 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1520  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0757766  normal  0.0239869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 504 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 199 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3608  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 188 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 374 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5481  transcriptional regulator PlcR, putative  35.14 
 
 		 285 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 201 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5199  transcriptional regulator, PlcR  35.14 
 
 		 213 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5033  transcription activator  35.14 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.191322  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5443  putative transcriptional regulator PlcR  35.14 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5049  transcriptional activator  35.14 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0730  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000239544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  28.05 
 
 		 206 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0155  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 132 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 187 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 199 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  29.73 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5529  putative transcriptional regulator PlcR  35.62 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5473  putative transcriptional regulator PlcR  35.62 
 
 		 285 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00043011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  29.75 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3268  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  28.79 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>