More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4288 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 588 aa  1172    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  53.5 
 
 		 545 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  52.74 
 
 		 541 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  55.56 
 
 		 541 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  47.28 
 
 		 593 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  44.47 
 
 		 583 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  48.27 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  40.69 
 
 		 515 aa  346  8e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  42.58 
 
 		 558 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  39.09 
 
 		 654 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  37.72 
 
 		 499 aa  320  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  34.52 
 
 		 493 aa  291  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  33.54 
 
 		 575 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  37 
 
 		 601 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  39.38 
 
 		 522 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  34.31 
 
 		 562 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  34.84 
 
 		 567 aa  284  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  36.18 
 
 		 540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  35.21 
 
 		 1088 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  35.21 
 
 		 1088 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  35.21 
 
 		 1088 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  36.42 
 
 		 556 aa  280  6e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  35.29 
 
 		 577 aa  280  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  34.15 
 
 		 548 aa  279  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  36.71 
 
 		 509 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  36.15 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  35.81 
 
 		 1110 aa  278  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  34.9 
 
 		 591 aa  278  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  36.35 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  35.31 
 
 		 606 aa  276  8e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  36.35 
 
 		 572 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4138  alpha amylase catalytic region  40.13 
 
 		 541 aa  275  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  34.21 
 
 		 1092 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  35.32 
 
 		 1115 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  35.25 
 
 		 682 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  35.71 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  34.87 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  33.4 
 
 		 1088 aa  271  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  34.55 
 
 		 598 aa  270  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  34.87 
 
 		 596 aa  270  8e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  34.87 
 
 		 596 aa  270  8e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  34.49 
 
 		 553 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  34.6 
 
 		 1113 aa  268  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  34.42 
 
 		 1101 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  32.81 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  34.77 
 
 		 1123 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  34.13 
 
 		 1088 aa  267  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  34.71 
 
 		 1138 aa  267  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  35.33 
 
 		 572 aa  266  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  33.21 
 
 		 1152 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  34.36 
 
 		 1102 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1154 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  34.36 
 
 		 1102 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  34.46 
 
 		 1088 aa  265  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  33.33 
 
 		 1100 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  34.12 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  36.16 
 
 		 604 aa  264  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  33.79 
 
 		 1104 aa  264  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  34.34 
 
 		 591 aa  264  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  33.97 
 
 		 1102 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  35.4 
 
 		 1106 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  34.31 
 
 		 1137 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  34.31 
 
 		 1137 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  34.31 
 
 		 1137 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  33.33 
 
 		 1100 aa  263  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  33.73 
 
 		 1137 aa  263  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  33.21 
 
 		 1154 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  33.4 
 
 		 1094 aa  262  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  34.17 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  33.84 
 
 		 1085 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  35.33 
 
 		 574 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5769  alpha amylase catalytic region  35.46 
 
 		 535 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08330  sucrose isomerase  34.41 
 
 		 600 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  33.6 
 
 		 1095 aa  261  3e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  33.73 
 
 		 1137 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  34.14 
 
 		 1106 aa  261  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  34.54 
 
 		 1164 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1475  alpha amylase catalytic region  32.26 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  34.14 
 
 		 1106 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  34.54 
 
 		 1164 aa  260  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  33.4 
 
 		 1139 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  34.84 
 
 		 567 aa  260  5.0000000000000005e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  33.71 
 
 		 1099 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  34.08 
 
 		 1108 aa  260  6e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1969  alpha amylase catalytic region  36.31 
 
 		 536 aa  259  9e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.786718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  36.53 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  32.95 
 
 		 1112 aa  259  1e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  34.82 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  33.65 
 
 		 1100 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  33.14 
 
 		 1100 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  33.97 
 
 		 610 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  32.76 
 
 		 1100 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  32.58 
 
 		 1121 aa  258  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  34.17 
 
 		 1131 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  34.17 
 
 		 1131 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  34.17 
 
 		 1131 aa  258  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  34.44 
 
 		 1111 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  33.96 
 
 		 1105 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  34.04 
 
 		 1093 aa  258  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  34.17 
 
 		 1131 aa  258  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>