More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4161 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4161  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
709 aa  1395    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0882638  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4619  glycosyl transferase family 51  28.16 
 
 
749 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2721  glycosyl transferase family 51  38.08 
 
 
656 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2627  glycosyl transferase family 51  37.69 
 
 
656 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.987259  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1238  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
655 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.368931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0426  glycosyl transferase family protein  46.62 
 
 
315 aa  154  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0045  glycosyl transferase family 51  33.46 
 
 
719 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.223797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2529  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
637 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664539  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3456  glycosyl transferase family 51  38.92 
 
 
307 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1388  glycosyl transferase family 51  31.44 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319404  normal  0.452017 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0116  transglycosylase  39.09 
 
 
317 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0079  glycosyl transferase family 51  42.16 
 
 
319 aa  147  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00663025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0062  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.62 
 
 
328 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8320699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  44 
 
 
734 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.67 
 
 
683 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4269  glycosyl transferase family protein  41.88 
 
 
317 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3403  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
322 aa  144  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0829  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
655 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  43.01 
 
 
712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  43.35 
 
 
720 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  40.44 
 
 
649 aa  139  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.2 
 
 
712 aa  138  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  48.94 
 
 
728 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.86 
 
 
776 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  45.51 
 
 
804 aa  137  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  39.25 
 
 
658 aa  137  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  48.94 
 
 
714 aa  137  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  41.94 
 
 
681 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  48.23 
 
 
728 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  48.23 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  48.23 
 
 
727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  50.36 
 
 
714 aa  135  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  40 
 
 
848 aa  135  3e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  42.21 
 
 
802 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  49.29 
 
 
706 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  41.14 
 
 
739 aa  134  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  47.52 
 
 
734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 
905 aa  133  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  41.14 
 
 
720 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 
735 aa  132  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
741 aa  131  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04891  putative penicillin binding protein  39.13 
 
 
589 aa  132  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  48.53 
 
 
691 aa  131  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 
732 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2700  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  45.32 
 
 
301 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240651  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0231  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.6 
 
 
320 aa  130  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  39.47 
 
 
838 aa  130  8.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2516  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.6 
 
 
236 aa  130  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0387388  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0170  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  40.24 
 
 
303 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  38.67 
 
 
837 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  38.92 
 
 
846 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.23 
 
 
820 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  40.72 
 
 
770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04511  putative penicillin binding protein  37.7 
 
 
589 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.534356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  45.77 
 
 
708 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  42.13 
 
 
775 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  40.66 
 
 
718 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  39.23 
 
 
834 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  38.92 
 
 
835 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  39.23 
 
 
837 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0269  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.93 
 
 
230 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202831  hitchhiker  0.000723227 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0579  penicillin-binding domain protein  39.56 
 
 
258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  39.04 
 
 
680 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  39.23 
 
 
834 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2444  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  46.94 
 
 
229 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000188115  normal  0.588429 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4759  penicillin-binding domain protein  39.56 
 
 
258 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868977  unclonable  4.4469700000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2326  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  44.06 
 
 
303 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0617  penicillin-binding domain protein  39.01 
 
 
258 aa  129  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0458  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000195671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  42.44 
 
 
712 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0512  penicillin-binding domain-containing protein  39.01 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000617961  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0455  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.01 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.97841e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0451  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  39.01 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000185121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0543  penicillin-binding domain-containing protein  39.01 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000216504  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0543  penicillin-binding domain protein  39.01 
 
 
258 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.7837e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  38.12 
 
 
839 aa  127  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04821  putative penicillin binding protein  38.25 
 
 
589 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.725323  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.29 
 
 
705 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  46.43 
 
 
755 aa  127  6e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0539  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.46 
 
 
230 aa  127  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  37.57 
 
 
796 aa  127  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0597  penicillin-binding domain-containing protein  38.46 
 
 
258 aa  127  7e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000108833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  39.3 
 
 
797 aa  127  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  37.57 
 
 
683 aa  127  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  36.96 
 
 
905 aa  126  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0146  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  43.88 
 
 
298 aa  126  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  38 
 
 
841 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0426  putative penicillin binding protein  37.7 
 
 
589 aa  126  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  34.76 
 
 
705 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3681  monofunctional biosynthetic peptidoglycan transglycosylase  48.61 
 
 
235 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  47.86 
 
 
795 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  38.12 
 
 
832 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0466  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
273 aa  126  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000321197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  34.76 
 
 
746 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 
705 aa  125  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  42.44 
 
 
757 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.32 
 
 
765 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  42.25 
 
 
807 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  36.41 
 
 
897 aa  125  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  36.41 
 
 
900 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>