More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4096 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  47.08 
 
 
1137 aa  935  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  58.5 
 
 
601 aa  680  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.02471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  46.33 
 
 
1100 aa  915  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  65.75 
 
 
553 aa  771  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  46.59 
 
 
1061 aa  932  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  42.36 
 
 
1098 aa  777  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  62.87 
 
 
572 aa  730  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  64.37 
 
 
548 aa  748  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  46.98 
 
 
1136 aa  951  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  49.91 
 
 
1088 aa  1026  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  47.45 
 
 
1106 aa  959  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  55.43 
 
 
1108 aa  1231  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  46.32 
 
 
1105 aa  936  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  48.5 
 
 
1092 aa  1019  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  48.94 
 
 
1088 aa  1004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  47.26 
 
 
1137 aa  939  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  46.5 
 
 
1137 aa  926  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  53.62 
 
 
1123 aa  1181  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  47.08 
 
 
1106 aa  952  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  46.45 
 
 
1101 aa  952  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  61.92 
 
 
556 aa  717  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  50.53 
 
 
1121 aa  1120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  51.15 
 
 
1098 aa  1140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  62.03 
 
 
571 aa  712  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  61.36 
 
 
596 aa  692  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  47.18 
 
 
1142 aa  979  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  45.99 
 
 
1131 aa  915  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  45.99 
 
 
1131 aa  915  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  49.43 
 
 
1102 aa  1022  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  45.64 
 
 
1131 aa  914  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  45.64 
 
 
1131 aa  917  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  61.36 
 
 
596 aa  691  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  45.99 
 
 
1131 aa  915  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  49.56 
 
 
1102 aa  1016  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  50.57 
 
 
1105 aa  1117  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  47.44 
 
 
1100 aa  959  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  8.83241e-07 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  47.65 
 
 
1110 aa  971  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  45.48 
 
 
1094 aa  955  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  45.97 
 
 
1152 aa  956  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  46.35 
 
 
1154 aa  977  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  46.87 
 
 
1093 aa  951  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  46.53 
 
 
1164 aa  951  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  52.06 
 
 
1116 aa  1154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  50 
 
 
1113 aa  1142  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  60.04 
 
 
604 aa  684  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  51.75 
 
 
1109 aa  1125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  57.07 
 
 
582 aa  656  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  6.1423e-06  hitchhiker  2.15015e-06 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  100 
 
 
1139 aa  2343  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  62.43 
 
 
601 aa  719  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  65.93 
 
 
551 aa  775  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  58.21 
 
 
562 aa  669  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  63.17 
 
 
567 aa  721  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  47.42 
 
 
1114 aa  1060  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  59.89 
 
 
610 aa  712  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2716  trehalose synthase  53.51 
 
 
964 aa  660  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  58.55 
 
 
591 aa  694  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  62.03 
 
 
577 aa  723  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  46.25 
 
 
1109 aa  957  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  45.95 
 
 
1108 aa  941  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  46.53 
 
 
1164 aa  951  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  45.5 
 
 
1101 aa  931  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  49.73 
 
 
1088 aa  1035  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  51.33 
 
 
1099 aa  1118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0240  trehalose synthase  50.53 
 
 
1105 aa  1107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  47.7 
 
 
1100 aa  967  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  51.06 
 
 
1098 aa  1128  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  65.19 
 
 
553 aa  770  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  51.49 
 
 
1116 aa  1152  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  46.87 
 
 
1093 aa  955  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  44.5 
 
 
1085 aa  878  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  52.73 
 
 
1130 aa  1170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  50.18 
 
 
1088 aa  1024  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  55.22 
 
 
1119 aa  1248  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  65.19 
 
 
572 aa  770  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  48.2 
 
 
1088 aa  1023  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  45.92 
 
 
1100 aa  962  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  61.93 
 
 
682 aa  722  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  46.94 
 
 
1100 aa  922  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  46.17 
 
 
1121 aa  969  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  46.44 
 
 
1113 aa  973  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  47.08 
 
 
1137 aa  935  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  46.13 
 
 
1154 aa  973  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  45.2 
 
 
1134 aa  927  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  48.11 
 
 
1099 aa  955  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  46.55 
 
 
1112 aa  981  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  48.74 
 
 
1121 aa  1041  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  49 
 
 
1100 aa  998  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  48.87 
 
 
1104 aa  1031  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  47.11 
 
 
1094 aa  964  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  55.96 
 
 
556 aa  645  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  47.62 
 
 
1088 aa  978  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  45.53 
 
 
1095 aa  927  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  62.23 
 
 
606 aa  728  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  46.26 
 
 
1108 aa  956  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  52.41 
 
 
1108 aa  1162  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  47.26 
 
 
1100 aa  960  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  61.9 
 
 
551 aa  733  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  46.27 
 
 
1160 aa  944  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  47.19 
 
 
1115 aa  1001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  47.07 
 
 
1100 aa  967  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>