More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4033 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
374 aa  746    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.78 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  47.1 
 
 
637 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  48.93 
 
 
1987 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  50.39 
 
 
623 aa  219  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  50.79 
 
 
1755 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  47.13 
 
 
490 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  36.78 
 
 
386 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  37.03 
 
 
386 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3645  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.1 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.340454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  47.51 
 
 
544 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  47.96 
 
 
543 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.51 
 
 
542 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  42.59 
 
 
478 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  42.39 
 
 
487 aa  163  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  40.88 
 
 
320 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.06 
 
 
319 aa  160  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.41 
 
 
498 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  46.32 
 
 
510 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  36.52 
 
 
727 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.04 
 
 
456 aa  152  8e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.38 
 
 
427 aa  150  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  37.24 
 
 
1264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.7 
 
 
402 aa  146  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  42.58 
 
 
420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  41.04 
 
 
447 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  41.97 
 
 
506 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.6 
 
 
428 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 
417 aa  138  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.86 
 
 
294 aa  135  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4651  Thrombospondin type 3 repeat protein  36 
 
 
671 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.85 
 
 
429 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5779  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 
570 aa  127  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  54.39 
 
 
193 aa  126  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  47.5 
 
 
525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  41.1 
 
 
401 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.04 
 
 
440 aa  116  7.999999999999999e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  49.06 
 
 
537 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  36.24 
 
 
540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  41.79 
 
 
214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.28 
 
 
214 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  49.51 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
215 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  42.54 
 
 
215 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
215 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  43.59 
 
 
510 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  36.22 
 
 
266 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
215 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  49.04 
 
 
169 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  34.97 
 
 
445 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  42.22 
 
 
215 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  47.32 
 
 
209 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  42.54 
 
 
232 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  42.22 
 
 
316 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  41.48 
 
 
261 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  44.17 
 
 
722 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  46.43 
 
 
209 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  42.98 
 
 
427 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  44.64 
 
 
212 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.13 
 
 
375 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.13 
 
 
375 aa  103  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  44.64 
 
 
294 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  44.64 
 
 
209 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
375 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
459 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  41.94 
 
 
422 aa  101  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  46.98 
 
 
792 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  55.17 
 
 
286 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1526  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  43.83 
 
 
722 aa  100  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000258397 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  28.92 
 
 
486 aa  99.8  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 
630 aa  100  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.26 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 
445 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.25 
 
 
344 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  33.47 
 
 
322 aa  99.8  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.91 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45.13 
 
 
217 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  42.11 
 
 
671 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.13 
 
 
217 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  38.71 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  38.71 
 
 
350 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  41.33 
 
 
209 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  37.91 
 
 
344 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.62 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 
449 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.51 
 
 
365 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  48.08 
 
 
236 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.25 
 
 
351 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  44.55 
 
 
320 aa  97.1  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  48.08 
 
 
216 aa  97.1  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 
432 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>