More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4027 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  100 
 
 		 149 aa  306  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 143 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 		 149 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1900  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.03474e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 		 142 aa  176  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  59.7 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  56.55 
 
 		 163 aa  173  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  173  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  57.58 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  58.78 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  59.57 
 
 		 147 aa  167  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  60.28 
 
 		 142 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  58.33 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  54.01 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0946  50S ribosomal protein L13  59.69 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000305629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  56.82 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  58.96 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2044  ribosomal protein L13  55.22 
 
 		 142 aa  165  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000510712  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0350  50S ribosomal protein L13  58.52 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.861215 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  58.21 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  55.17 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 142 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2789  50S ribosomal protein L13  56.72 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000137696  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  55.47 
 
 		 144 aa  164  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 143 aa  164  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3518  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3372  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3454  50S ribosomal protein L13  54.73 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1669  50S ribosomal protein L13  60.61 
 
 		 142 aa  164  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000843127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1981  50S ribosomal protein L13  56.3 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0574002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  163  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  58.78 
 
 		 144 aa  163  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  163  9e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  54.61 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  53.96 
 
 		 142 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.55 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  59.4 
 
 		 147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.34 
 
 		 151 aa  161  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4943  50S ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000721803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  54.41 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.73 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  56.59 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  58.59 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000679553  normal  0.257999 
 
 
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  58.21 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  55.3 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  57.04 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 170 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  53.9 
 
 		 148 aa  160  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000000965518  hitchhiker  0.0000000000992925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  160  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  54.07 
 
 		 144 aa  160  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  54.2 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  54.2 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  54.48 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  54.68 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  53.52 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  51.05 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  53.03 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 143 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 143 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  50.35 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  53.9 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  55.73 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  53.1 
 
 		 145 aa  158  3e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  53.38 
 
 		 147 aa  157  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  55.56 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  52.48 
 
 		 142 aa  157  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3437  50S ribosomal protein L13  52.45 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.170329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1469  50S ribosomal protein L13  52.63 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.863106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>