More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4020 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  57.31 
 
 		 175 aa  215  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  56.73 
 
 		 175 aa  214  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  57.31 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  56.98 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 175 aa  210  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 175 aa  210  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  55.49 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  57.71 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  57.71 
 
 		 179 aa  208  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  57.71 
 
 		 179 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  56.82 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  49.44 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 176 aa  197  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  51.15 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  51.72 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  50 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  51.72 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  47.49 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  52 
 
 		 180 aa  192  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 		 184 aa  191  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  52.6 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  48.84 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  50.85 
 
 		 193 aa  189  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  50.85 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  52 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  50.83 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  49.2 
 
 		 187 aa  187  5.999999999999999e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 176 aa  187  5.999999999999999e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  48.55 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  49.71 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  50.57 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 194 aa  187  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 194 aa  187  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  46.51 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  48.55 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  52.6 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  48.55 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  48.85 
 
 		 190 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  48.55 
 
 		 176 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  46.82 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  46.55 
 
 		 177 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  47.7 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  48.26 
 
 		 185 aa  184  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 177 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  50.29 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  47.98 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>