More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4008 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4008  ribosomal protein S7  100 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0613135  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  64.81 
 
 
156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  64.81 
 
 
156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  64.81 
 
 
156 aa  218  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0493  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  213  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00259026  hitchhiker  0.0000000489129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0323  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  213  8e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.111049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0311  30S ribosomal protein S7  64.2 
 
 
156 aa  210  5.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00398327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  210  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  210  7e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  210  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  62.35 
 
 
156 aa  209  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  61.11 
 
 
156 aa  208  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
155 aa  209  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  62.35 
 
 
156 aa  208  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  64.2 
 
 
156 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  208  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  207  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  207  5e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  61.73 
 
 
156 aa  206  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  206  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  64.81 
 
 
156 aa  206  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  61.11 
 
 
156 aa  205  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  204  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  61.73 
 
 
156 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  65.43 
 
 
156 aa  204  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0929  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  204  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000450114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3332  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  204  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  61.73 
 
 
156 aa  204  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002298  SSU ribosomal protein S7p (S5e)  62.96 
 
 
156 aa  203  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000149814  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  203  8e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  203  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  203  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0192  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0139894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4060  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00273725  hitchhiker  0.00000107053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  56.79 
 
 
156 aa  202  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5077  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  202  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48588  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0196  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00224175  hitchhiker  0.00012084 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4466  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0622  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000278965  decreased coverage  1.81754e-21 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0236  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4321  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00151135  unclonable  0.0000000000975416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0166  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000261088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3763  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  202  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000673821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1280  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  202  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.537856  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  201  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  201  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1013  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0985  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.524991  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1003  30S ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  200  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  62.35 
 
 
156 aa  201  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1646  30S ribosomal protein S7  61.11 
 
 
156 aa  201  5e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000714502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  200  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  63.58 
 
 
156 aa  200  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  200  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  200  7e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  200  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  62.96 
 
 
156 aa  200  8e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  200  9e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  200  9e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3468  ribosomal protein S7  61.11 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  58.02 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  56.79 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  58.02 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  56.79 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0683  30S ribosomal protein S7  61.73 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  56.79 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  58.9 
 
 
157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2663  ribosomal protein S7  62.35 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  197  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  198  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1245  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  198  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.671959  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  59.88 
 
 
156 aa  197  3e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03940  30S ribosomal protein S7  59.26 
 
 
156 aa  197  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3147  ribosomal protein S7  60.49 
 
 
156 aa  197  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.965712  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  197  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  58.02 
 
 
156 aa  197  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  56.79 
 
 
156 aa  197  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  58.64 
 
 
156 aa  197  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  57.41 
 
 
156 aa  197  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  61.73 
 
 
156 aa  197  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20920  SSU ribosomal protein S7P  59.26 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>