More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4004 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2019  50S ribosomal protein L4  52.38 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1945  50S ribosomal protein L4  53.11 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 207 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  48.33 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1934  50S ribosomal protein L4  51.67 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1912  50S ribosomal protein L4  53.11 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  50.49 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  44.5 
 
 		 207 aa  188  5e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  46.89 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  47.37 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  43.06 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  45.24 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  45.93 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  45.93 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  43.33 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3327  50S ribosomal protein L4  45.02 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.78315e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0934  50S ribosomal protein L4  45.02 
 
 		 207 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000521211  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  44.02 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 207 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  44.66 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  41.63 
 
 		 207 aa  174  7e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  43.69 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  44.5 
 
 		 206 aa  171  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  43.33 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  42.58 
 
 		 207 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  43.54 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  42.86 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  44.02 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2687  50S ribosomal protein L4  43.06 
 
 		 206 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0662732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  45.45 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  41.43 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  40.67 
 
 		 205 aa  161  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  41.15 
 
 		 208 aa  161  9e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  37.8 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  40.78 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  42.72 
 
 		 208 aa  158  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5125  ribosomal protein L4/L1e  43 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  42.41 
 
 		 221 aa  157  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  41.95 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3434  ribosomal protein L4/L1e  44.1 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  42.65 
 
 		 209 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2906  ribosomal protein L4/L1e  45.69 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  39.71 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2618  50S ribosomal protein L4/L1e  46.56 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0455519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0768  50S ribosomal protein L4  41.45 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000241518  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2063  50S ribosomal protein L4  41.83 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000340203  normal  0.385687 
 
 
-
 
NC_002978  WD0680  50S ribosomal protein L4  38.24 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0323983  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0611  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.937443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  39.34 
 
 		 207 aa  151  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2645  50S ribosomal protein L4  43 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2219  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1909  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00049189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0584  50S ribosomal protein L4  42.58 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.745098 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0181  50S ribosomal protein L4  38.94 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000196789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0490  50S ribosomal protein L4  41.97 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.789827  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  40.82 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  40.38 
 
 		 212 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0410  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  38.28 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  38.46 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  38.76 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1794  50S ribosomal protein L4  41.67 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130776  normal  0.0731355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2967  50S ribosomal protein L4  45.37 
 
 		 204 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.191884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  41.63 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1677  50S ribosomal protein L4  39.41 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05720  50S ribosomal protein L4  38.65 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.316206  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  39.42 
 
 		 214 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0603  ribosomal protein L4/L1e  37.5 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4506  ribosomal protein L4/L1e  43.78 
 
 		 292 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  39.52 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  38.12 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1355  50S ribosomal protein L4  39.13 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.700981  normal  0.0533022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  41.55 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1945  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1227  50S ribosomal protein L4  37.67 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150568  unclonable  0.0000101553 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0352  50S ribosomal protein L4  42.16 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  37.14 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20860  LSU ribosomal protein L4P  41.67 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.699759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>