More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4000 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  100 
 
 
114 aa  228  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  54.39 
 
 
113 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  54.39 
 
 
113 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  47.79 
 
 
111 aa  122  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
110 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
110 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  52.63 
 
 
113 aa  121  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0115  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000621136  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0111  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.44613e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0109  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108329  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0115  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000016654  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0110  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0127  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.10741e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
111 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  52.63 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  51.75 
 
 
113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0115  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000818335  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0136  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0146  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000364158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5190  50S ribosomal protein L22  49.12 
 
 
113 aa  117  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000302093  unclonable  1.1617299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2706  ribosomal protein L22  52.29 
 
 
118 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
111 aa  116  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
111 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0109  50S ribosomal protein L22  48.25 
 
 
113 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000370436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  47.75 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  51.85 
 
 
114 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  50.88 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0502  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 
111 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.195927  hitchhiker  0.000000000290326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0332  50S ribosomal protein L22  54.95 
 
 
111 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.328707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  49.12 
 
 
113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  53.64 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2252  50S ribosomal protein L22  49.11 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000407093  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  50.88 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  49.11 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  47.75 
 
 
113 aa  111  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2328  ribosomal protein L22  52.25 
 
 
113 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000276049  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0872  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
111 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000233531  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2169  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  51.79 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2614  50S ribosomal protein L22  45.95 
 
 
165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00503824  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  48.18 
 
 
114 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3910  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000355521  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0325  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
110 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0199306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0589  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118161  normal  0.432956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0288  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000016922  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4539  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175116  hitchhiker  0.00188816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001737  LSU ribosomal protein L22p (L17e)  54.13 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000377263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0761  50S ribosomal protein L22  52.73 
 
 
111 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000305048  decreased coverage  0.00987219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2769  ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  107  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000988714  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 
112 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00735  50S ribosomal protein L22  54.13 
 
 
110 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1389  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000788979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1297  50S ribosomal protein L22  48.65 
 
 
159 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000469382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03166  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0020187  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0398  ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000320162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3610  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000037432  hitchhiker  0.00902859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  52.68 
 
 
110 aa  105  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0328  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000986458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3739  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.334388  normal  0.0231342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4638  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0328992  normal  0.0807063 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0410  50S ribosomal protein L22P  50.45 
 
 
109 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000110454  normal  0.134806 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3700  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000326609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0398  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000614919  hitchhiker  0.000253189 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3509  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131038  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3631  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000221962  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3704  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000889443  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3798  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000622145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03117  hypothetical protein  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00216887  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3802  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0244265  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3631  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026549  normal  0.464818 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04516  50S ribosomal protein L22  51.82 
 
 
111 aa  106  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000201226  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3817  50S ribosomal protein L22  54.37 
 
 
110 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000551944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  48.65 
 
 
110 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0410  50S ribosomal protein L22  52.25 
 
 
110 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00607313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  49.55 
 
 
110 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3746  50S ribosomal protein L22  51.35 
 
 
110 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000646625  hitchhiker  0.0040389 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0064  50S ribosomal protein L22  53.15 
 
 
110 aa  105  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000121293  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3996  50S ribosomal protein L22  54.37 
 
 
110 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000093676  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1740  50S ribosomal protein L22  47.27 
 
 
120 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000076776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23760  LSU ribosomal protein L22P  47.41 
 
 
117 aa  104  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.821125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  55 
 
 
115 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  46.79 
 
 
113 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0163  50S ribosomal protein L22  56.57 
 
 
110 aa  104  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000850597  decreased coverage  0.0000466099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2059  50S ribosomal protein L22  46.61 
 
 
118 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000104467  normal  0.229669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  50.47 
 
 
127 aa  104  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 
112 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00450  50S ribosomal protein L22  50.89 
 
 
110 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00735993  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  49.55 
 
 
109 aa  103  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2313  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 
117 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000419164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0218  50S ribosomal protein L22  56.57 
 
 
110 aa  103  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000966371  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2272  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 
117 aa  103  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000696854  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01220  50S ribosomal protein L22  46.49 
 
 
113 aa  103  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.860809  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4348  ribosomal protein L22  42.11 
 
 
124 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000469697  normal  0.116233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17110  50S ribosomal protein L22  45.3 
 
 
121 aa  103  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0887543  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1826  50S ribosomal protein L22  45.61 
 
 
117 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.424136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2023  50S ribosomal protein L22  48.08 
 
 
146 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.734149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1938  50S ribosomal protein L22  48.08 
 
 
146 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>