More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3993 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  100 
 
 		 223 aa  453  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  72.16 
 
 		 179 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 180 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 180 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  68.18 
 
 		 180 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  67.05 
 
 		 180 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 		 179 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 		 179 aa  256  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  254  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 183 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  55.87 
 
 		 220 aa  251  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 180 aa  249  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  65.34 
 
 		 179 aa  248  5e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 180 aa  247  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  62.01 
 
 		 182 aa  246  2e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 181 aa  246  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  244  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 178 aa  243  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 178 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  62.57 
 
 		 182 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  63.84 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  242  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  60.34 
 
 		 180 aa  242  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  63.07 
 
 		 179 aa  241  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 180 aa  241  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0613  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 181 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 178 aa  240  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 180 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  64.2 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4158  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000453128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4044  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000208905  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0182  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000628056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0160  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0212  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000287667  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0208  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4305  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000316279  unclonable  0.0000000000574011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  60.57 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  239  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 178 aa  238  4e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  238  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0279  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 		 187 aa  238  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000257313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0225  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000033393  unclonable  0.00000847343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 		 184 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  61.93 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00950  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00204623  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  56.91 
 
 		 192 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  60.23 
 
 		 179 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3007  50S ribosomal protein L5  63.07 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00431822  normal  0.0527819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 		 180 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0727  ribosomal protein L5  60.99 
 
 		 184 aa  236  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 		 181 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3167  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 180 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000061863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  58.92 
 
 		 186 aa  236  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1920  ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 188 aa  235  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.87466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.57 
 
 		 180 aa  235  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  235  5.0000000000000005e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  61.93 
 
 		 180 aa  234  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0341  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 		 188 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  234  8e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4737  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00873114  normal  0.498496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 		 180 aa  234  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 184 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1001  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 		 179 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00040162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2312  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.237365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3897  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000030586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5067  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000562403  normal  0.121811 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 		 179 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.64 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>