More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3989 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  100 
 
 		 123 aa  246  7e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  49.15 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 		 114 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  117  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50.45 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  49.56 
 
 		 117 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  43.33 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  48.25 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  46.9 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  46.9 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 121 aa  110  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  48.25 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  48.25 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  48.7 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  47.15 
 
 		 124 aa  110  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  44.72 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  50 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  47.32 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  48.67 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  51 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  47.32 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 119 aa  104  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  45.13 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  45.61 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  44.92 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  45.61 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  51 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  44.25 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  45.53 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  47.79 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  47.86 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  41.8 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  46.61 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  45.76 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  46.72 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  42.86 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  51 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 119 aa  100  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  44.55 
 
 		 120 aa  100  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  44.83 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  45.67 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 118 aa  100  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  46.72 
 
 		 120 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  48.18 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 		 127 aa  100  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  43.22 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  49.56 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  50.47 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  43.22 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  46.08 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  51 
 
 		 119 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  48.04 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  46.43 
 
 		 121 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  45 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  44.74 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  50.46 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  45.61 
 
 		 120 aa  98.2  3e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  47.46 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>