More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3987 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3987  ribosomal protein L30  100 
 
 		 61 aa  121  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0158731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0719  ribosomal protein L30  63.79 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.545555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0125  50S ribosomal protein L30  57.38 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0129  50S ribosomal protein L30  55.74 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.64876  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1633  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1166  ribosomal protein L30  62.26 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0608924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  58.62 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0078  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 60 aa  67  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0903493  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0600  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0706  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.214746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4361  ribosomal protein L30  58.18 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000836724  normal  0.0761791 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  58.62 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0860  ribosomal protein L30  55.17 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  59.26 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  57.41 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0840  50S ribosomal protein L30  54.39 
 
 		 62 aa  63.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1335  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  55.36 
 
 		 60 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  57.89 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0188  50S ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158011  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0620  ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.752078 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  55.17 
 
 		 61 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23620  LSU ribosomal protein L30P  49.15 
 
 		 59 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844957  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  62.4  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0176  ribosomal protein L30  55.93 
 
 		 60 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000191615  hitchhiker  0.000355415 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0231  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000564159  unclonable  0.00000731174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0619  ribosomal protein L30  50 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.191878  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0439  50S ribosomal protein L30P  55.56 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.188702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0123  50S ribosomal protein L30  55 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000032367  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2984  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 61 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.368791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0249  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4038  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000117775  unclonable  0.00000000000200607 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0218  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000314653  hitchhiker  0.0000935583 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0214  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000115518  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3741  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000000717278  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4152  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000726837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0128  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603924  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0128  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000211905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0124  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000437518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0122  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000462232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0149  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00257055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0128  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0194102  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0159  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00008814  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0140  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 62 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0122  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000141296  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10736  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000107725  normal  0.417501 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  50.88 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5177  50S ribosomal protein L30  53.33 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138401  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05810  ribosomal protein L30  56.14 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0423  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0858998  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2160  ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0544492  normal  0.73473 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2670  50S ribosomal protein L30  55.77 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245822  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0212  50S ribosomal protein L30  54.24 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  hitchhiker  0.00666763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03153  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00272403  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0411  ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158772  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3597  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0159663  normal  0.022282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0726  ribosomal protein L30  54 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0489347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3983  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.234859  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4625  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000160254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0341  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00191247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0971  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 61 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6031  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0562  50S ribosomal protein L30  55.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0217  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000105847  unclonable  0.0000000000126926 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1506  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.41299  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0411  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000870321  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3785  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000084288  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0217  50S ribosomal protein L30  52.54 
 
 		 60 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  hitchhiker  0.000000000956055 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3687  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288891  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03104  hypothetical protein  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00160317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3320  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00901204  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3496  50S ribosomal protein L30  53.45 
 
 		 59 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000235964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  50 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4303  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0337  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000664675  unclonable  0.000000038279 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0199  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.166144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0502  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000181767  normal  0.0669565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2800  ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.683701 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3726  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.990578  normal  0.0950772 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0507  50S ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0161189  hitchhiker  0.00326303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2628  50S ribosomal protein L30  52.73 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115062  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3789  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.143721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3691  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0510411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>