More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3982 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 127 aa  249  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  73.55 
 
 		 122 aa  186  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  71.77 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  72.73 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 122 aa  174  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 122 aa  173  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  71.9 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  70.25 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  69.29 
 
 		 125 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  71.07 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  72.17 
 
 		 123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 126 aa  170  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  69.57 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  69.57 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  68.85 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  70.43 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  69.42 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 124 aa  166  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 121 aa  166  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 123 aa  166  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  68.6 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.96 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  66.94 
 
 		 124 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  66.09 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  164  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1364  30S ribosomal protein S13  69.49 
 
 		 126 aa  164  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  70.43 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  67.77 
 
 		 122 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 123 aa  163  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 122 aa  164  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  65.35 
 
 		 122 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  64.35 
 
 		 123 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13497  30S ribosomal protein S13  66.12 
 
 		 124 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000125579  normal  0.574035 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 122 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  62.2 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  67.26 
 
 		 123 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  63.49 
 
 		 126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3898  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  161  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4289  30S ribosomal protein S13  62.7 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.532691  hitchhiker  0.0012872 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0611  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 124 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  68.7 
 
 		 122 aa  160  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 126 aa  160  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  66.96 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3385  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 		 123 aa  159  9e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 127 aa  159  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  68.7 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0652  ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1169  ribosomal protein S13  65.62 
 
 		 125 aa  158  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  61.42 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 126 aa  157  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5048  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0590197  normal  0.99624 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  62.81 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  158  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  62.99 
 
 		 122 aa  157  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  62.2 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  63.78 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29480  SSU ribosomal protein S13P  60.33 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0570342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04230  SSU ribosomal protein S13P  65.22 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3115  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  157  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2942  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0382376  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 125 aa  157  6e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 		 125 aa  156  7e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1214  30S ribosomal protein S13  60.32 
 
 		 126 aa  156  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>