207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3930 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
247 aa  494  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.37 
 
 
258 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
263 aa  141  1e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
263 aa  141  1e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.39 
 
 
278 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.4 
 
 
269 aa  135  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.99 
 
 
269 aa  134  2e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.7 
 
 
250 aa  125  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.79 
 
 
338 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  38.79 
 
 
338 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.65 
 
 
231 aa  122  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.79 
 
 
1153 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.34 
 
 
259 aa  121  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.5 
 
 
265 aa  120  2e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.1 
 
 
264 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.89 
 
 
228 aa  117  2e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  36.96 
 
 
273 aa  116  4e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.92 
 
 
258 aa  114  1e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.77 
 
 
232 aa  110  2e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.31 
 
 
285 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.73 
 
 
285 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.89 
 
 
285 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2394  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.33 
 
 
240 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0672115  normal  0.448912 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.73 
 
 
287 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.62 
 
 
226 aa  101  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.5 
 
 
242 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.06 
 
 
292 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2124  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.91 
 
 
240 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.908976 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.96 
 
 
245 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
253 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0472  hypothetical protein  33.91 
 
 
240 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
242 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.86 
 
 
299 aa  99.4  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.27 
 
 
328 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.88 
 
 
283 aa  99  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
837 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.92 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6773  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.67063  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.77 
 
 
328 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.79 
 
 
252 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0344  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
808 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5868  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.432007  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.17 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.08 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4120  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1072  hypothetical protein  30.4 
 
 
270 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348031  normal  0.384131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.46 
 
 
243 aa  92  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.26 
 
 
260 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0442  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.71 
 
 
262 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.87 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0469  hypothetical protein  30.74 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744864  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.64 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0381  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.49 
 
 
251 aa  86.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.853038  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.43 
 
 
257 aa  86.3  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.21 
 
 
235 aa  85.9  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2238  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.17 
 
 
251 aa  85.1  1e-15  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4016  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.72 
 
 
276 aa  84  2e-15  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34924e-06 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.02 
 
 
252 aa  84.3  2e-15  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
242 aa  83.6  3e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  32.49 
 
 
277 aa  83.6  3e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
261 aa  82.4  6e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
261 aa  82.4  6e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0420  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.22 
 
 
236 aa  81.3  1e-14  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 
246 aa  80.1  3e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.71 
 
 
246 aa  79.7  4e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.63 
 
 
281 aa  79.3  5e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2380  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.16 
 
 
251 aa  78.6  1e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
282 aa  77.8  1e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3150  hypothetical protein  30.49 
 
 
245 aa  77.8  1e-13  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.610238  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.26 
 
 
244 aa  77.8  2e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2216  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.38 
 
 
243 aa  77  3e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0209  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.36 
 
 
283 aa  76.6  3e-13  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.02 
 
 
279 aa  76.3  4e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4298  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.65 
 
 
259 aa  75.1  9e-13  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36680  hypothetical protein  30.08 
 
 
245 aa  74.7  1e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21271  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3642  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.58 
 
 
249 aa  74.7  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3724  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
279 aa  74.7  1e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.236792  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3767  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.25 
 
 
252 aa  73.9  2e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0769557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.78 
 
 
265 aa  73.2  3e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
266 aa  73.2  4e-12  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  27.27 
 
 
302 aa  73.2  4e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.81 
 
 
279 aa  72.8  5e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0510  hypothetical protein  26.09 
 
 
257 aa  72  7e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.28 
 
 
257 aa  72  8e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.61 
 
 
244 aa  72  8e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0534  hypothetical protein  26.09 
 
 
257 aa  72  9e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0813  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28 
 
 
253 aa  71.2  1e-11  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0192282  normal  0.85473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1281  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.91 
 
 
253 aa  71.6  1e-11  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2852  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28 
 
 
253 aa  71.2  1e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.350943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0938  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28 
 
 
253 aa  71.2  2e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.45 
 
 
257 aa  70.9  2e-11  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2853  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.87 
 
 
253 aa  70.1  3e-11  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512011 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0908  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.82 
 
 
252 aa  70.1  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0848  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.82 
 
 
252 aa  70.1  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0940  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  27.82 
 
 
252 aa  70.1  3e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00426171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>