286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3903 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3903  histidine ammonia-lyase  100 
 
 
520 aa  1028    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.23664  normal  0.18215 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0239  histidine ammonia-lyase  49.13 
 
 
516 aa  496  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0486483  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2378  histidine ammonia-lyase  51.48 
 
 
509 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43897  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1814  histidine ammonia-lyase  59.41 
 
 
508 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1410  histidine ammonia-lyase  57.02 
 
 
516 aa  491  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2046  histidine ammonia-lyase  59.21 
 
 
508 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.034077  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2116  histidine ammonia-lyase  59.21 
 
 
508 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2820  histidine ammonia-lyase  47.43 
 
 
507 aa  480  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2170  histidine ammonia-lyase  48.72 
 
 
508 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0916  histidine ammonia-lyase  51.4 
 
 
511 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1637  histidine ammonia-lyase  54.12 
 
 
506 aa  468  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.798951 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0588  histidine ammonia-lyase  47.51 
 
 
507 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0281  histidine ammonia-lyase  48.37 
 
 
508 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2331  histidine ammonia-lyase  52.6 
 
 
506 aa  455  1e-127  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.962359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3680  histidine ammonia-lyase  47.43 
 
 
505 aa  451  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0108236  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1556  histidine ammonia-lyase  47.23 
 
 
505 aa  449  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000269736  normal  0.0117376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3685  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 
505 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000336671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3760  histidine ammonia-lyase  47.43 
 
 
506 aa  451  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00715091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3442  histidine ammonia-lyase  46.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0533045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3405  histidine ammonia-lyase  46.56 
 
 
505 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000956551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3354  histidine ammonia-lyase  46.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3712  histidine ammonia-lyase  46.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000019442  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3662  histidine ammonia-lyase  46.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2730  histidine ammonia-lyase  53.51 
 
 
499 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2312  histidine ammonia-lyase  47.17 
 
 
505 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.01107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3339  histidine ammonia-lyase  46.82 
 
 
505 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000343122  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0129  histidine ammonia-lyase  45.53 
 
 
489 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0158  histidine ammonia-lyase  50.49 
 
 
517 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1777  histidine ammonia-lyase  45.95 
 
 
505 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.229891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1265  histidine ammonia-lyase  50.2 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1043  histidine ammonia-lyase  51.28 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.693412  normal  0.100833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0719  histidine ammonia-lyase  46.6 
 
 
498 aa  441  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1594  histidine ammonia-lyase  53.65 
 
 
508 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0822  histidine ammonia-lyase  47.76 
 
 
511 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107913  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03126  histidine ammonia-lyase  46.79 
 
 
538 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.840651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3094  histidine ammonia-lyase  50.1 
 
 
513 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1658  histidine ammonia-lyase  47.31 
 
 
526 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180825  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2550  histidine ammonia-lyase  50.82 
 
 
513 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0084  histidine ammonia-lyase  47.89 
 
 
510 aa  429  1e-119  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4446  histidine ammonia-lyase  47.7 
 
 
510 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4837  histidine ammonia-lyase  47.7 
 
 
510 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5275  histidine ammonia-lyase  49.37 
 
 
515 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4833  histidine ammonia-lyase  49.58 
 
 
515 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0366  histidine ammonia-lyase  48.28 
 
 
510 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.814528 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0941  histidine ammonia-lyase  48.41 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0804  histidine ammonia-lyase  48.85 
 
 
511 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.422259  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0855  histidine ammonia-lyase  48.89 
 
 
506 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0886  histidine ammonia-lyase  48.69 
 
 
506 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3901  histidine ammonia-lyase  46.75 
 
 
511 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912183  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4168  histidine ammonia-lyase  47.09 
 
 
510 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0918  histidine ammonia-lyase  48.69 
 
 
506 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.19052  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5482  histidine ammonia-lyase  48.78 
 
 
507 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.211889  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2642  histidine ammonia-lyase  49.48 
 
 
518 aa  425  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1022  histidine ammonia-lyase  45.07 
 
 
509 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0103  histidine ammonia-lyase  47.09 
 
 
513 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3952  histidine ammonia-lyase  48.15 
 
 
512 aa  425  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003723  histidine ammonia-lyase  46.33 
 
 
511 aa  421  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00913143  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1264  histidine ammonia-lyase  48.17 
 
 
506 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0098  histidine ammonia-lyase  47.29 
 
 
513 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4251  histidine ammonia-lyase  46.89 
 
 
513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0645  histidine ammonia-lyase  48.89 
 
 
529 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.125977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0827  histidine ammonia-lyase  48.29 
 
 
506 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294508  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0098  histidine ammonia-lyase  46.89 
 
 
513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1297  histidine ammonia-lyase  48.52 
 
 
511 aa  420  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0927091 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02072  histidine ammonia-lyase  46.73 
 
 
514 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1814  histidine ammonia-lyase  48.31 
 
 
507 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.74245  normal  0.102325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0080  histidine ammonia-lyase  46.89 
 
 
513 aa  421  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0100  histidine ammonia-lyase  47.09 
 
 
513 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1458  histidine ammonia-lyase  49 
 
 
515 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0209656  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0095  histidine ammonia-lyase  47.09 
 
 
513 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1603  histidine ammonia-lyase  48.59 
 
 
507 aa  422  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.329412  normal  0.712329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0103  histidine ammonia-lyase  46.89 
 
 
513 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0101  histidine ammonia-lyase  47.09 
 
 
513 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2366  histidine ammonia-lyase  48.89 
 
 
533 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2716  histidine ammonia-lyase  48.15 
 
 
526 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2796  histidine ammonia-lyase  48.89 
 
 
529 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1681  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1820  histidine ammonia-lyase  48.69 
 
 
514 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0708  histidine ammonia-lyase  46.34 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.085386  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0576  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
509 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000203792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2919  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2723  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4040  histidine ammonia-lyase  45.74 
 
 
524 aa  418  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3756  histidine ammonia-lyase  46.49 
 
 
510 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0185291 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2667  histidine ammonia-lyase  49.49 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0314474  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2189  histidine ammonia-lyase  49.39 
 
 
507 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5032  histidine ammonia-lyase  49.27 
 
 
510 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0432  histidine ammonia-lyase  48.47 
 
 
510 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44898  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0908  histidine ammonia-lyase  45.51 
 
 
514 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4632  histidine ammonia-lyase  50.55 
 
 
509 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.551445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2947  histidine ammonia-lyase  48.39 
 
 
507 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0126455  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0058  histidine ammonia-lyase  48.79 
 
 
511 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2985  histidine ammonia-lyase  47.42 
 
 
511 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.981657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2211  histidine ammonia-lyase  48.78 
 
 
507 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4906  histidine ammonia-lyase  49.27 
 
 
510 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685103  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1530  histidine ammonia-lyase  48.59 
 
 
507 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.851036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2088  histidine ammonia-lyase  48.78 
 
 
507 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.358963  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2006  histidine ammonia-lyase  47.12 
 
 
522 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.34717  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5082  histidine ammonia-lyase  48.65 
 
 
510 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150624  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5905  histidine ammonia-lyase  48.68 
 
 
507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>