More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3855 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3855  NusA antitermination factor  100 
 
 		 538 aa  1073    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0719337  normal  0.0942338 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1160  NusA antitermination factor  56.03 
 
 		 557 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1228  NusA antitermination factor  56.03 
 
 		 557 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1100  NusA antitermination factor  56.03 
 
 		 557 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1139  NusA antitermination factor  55.56 
 
 		 556 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1899  transcription elongation factor NusA  54.64 
 
 		 383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000368219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1584  transcription elongation factor NusA  56.57 
 
 		 381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1300  transcription elongation factor NusA  54.31 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000861889  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1586  transcription elongation factor NusA  55.5 
 
 		 385 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00876176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2983  transcription elongation factor NusA  54.31 
 
 		 382 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0049800000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1553  transcription elongation factor NusA  53.23 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.02973e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3036  transcription elongation factor NusA  45.35 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00201036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1227  transcription elongation factor NusA  47.73 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000158035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0961  transcription elongation factor NusA  54.62 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.462921  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1667  transcription elongation factor NusA  55.32 
 
 		 385 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3928  transcription elongation factor NusA  44.2 
 
 		 534 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1049  NusA antitermination factor  44.31 
 
 		 538 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2297  NusA antitermination factor  44.82 
 
 		 532 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0358902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0749  transcription elongation factor NusA  44.4 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2075  transcription elongation factor NusA  44.2 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2163  transcription elongation factor NusA  44.2 
 
 		 537 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1252  transcription elongation factor NusA  42.4 
 
 		 537 aa  369  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4616  NusA antitermination factor  44.29 
 
 		 536 aa  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0831604  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2925  NusA antitermination factor  44.36 
 
 		 545 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  0.0501763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2613  NusA antitermination factor  44.29 
 
 		 544 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.109477  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2821  NusA antitermination factor  44.36 
 
 		 560 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2699  transcription termination factor NusA  44.36 
 
 		 545 aa  365  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.311383  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0166  transcription elongation factor NusA  46.26 
 
 		 538 aa  362  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.590136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3729  NusA antitermination factor  44.16 
 
 		 545 aa  362  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0217708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0029  transcription elongation factor NusA  44.11 
 
 		 536 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4389  transcription elongation factor NusA  43.4 
 
 		 533 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0295  transcription elongation factor NusA  47.89 
 
 		 531 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0917388  normal  0.0106159 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3439  transcription elongation factor NusA  43.51 
 
 		 552 aa  360  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0022  transcription elongation factor NusA  43.82 
 
 		 538 aa  358  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3626  NusA antitermination factor  44.37 
 
 		 536 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.475474 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0442  transcription elongation factor NusA  47.88 
 
 		 537 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4069  transcription elongation factor NusA  43 
 
 		 535 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0598  transcription elongation factor NusA  43.91 
 
 		 539 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0478  transcription elongation factor NusA  45.7 
 
 		 541 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.779193  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0233  transcription elongation factor NusA  44.11 
 
 		 540 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0055  transcription elongation factor NusA  45.18 
 
 		 537 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2755  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 		 534 aa  351  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0382786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3041  transcription elongation factor NusA  43.2 
 
 		 572 aa  349  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3561  transcription elongation factor NusA  41.83 
 
 		 544 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3779  transcription elongation factor NusA  47.18 
 
 		 516 aa  346  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2824  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1163  transcription elongation factor NusA  43.33 
 
 		 535 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.605286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0223  transcription elongation factor NusA  43.05 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0031  transcription elongation factor NusA  42.28 
 
 		 568 aa  342  8e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0994  NusA antitermination factor  44.59 
 
 		 404 aa  342  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000558995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2515  transcription elongation factor NusA  42.42 
 
 		 443 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3729  NusA antitermination factor  42.35 
 
 		 506 aa  339  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2492  transcription elongation factor NusA  42.8 
 
 		 544 aa  337  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0183695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2431  transcription elongation factor NusA  42.12 
 
 		 428 aa  337  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.786529  normal  0.585225 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3161  transcription elongation factor NusA  41.47 
 
 		 429 aa  334  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00111335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0610  transcription elongation factor NusA  45.65 
 
 		 548 aa  333  5e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.131908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2068  transcription elongation factor NusA  44.16 
 
 		 523 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.571828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0497  transcription elongation factor NusA  42.55 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2592  transcription elongation factor NusA  41.88 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.808645  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3819  transcription elongation factor NusA  46.57 
 
 		 529 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0061  transcription elongation factor NusA  41.25 
 
 		 449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.941395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1047  NusA antitermination factor  47.91 
 
 		 362 aa  326  5e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000154988  unclonable  0.0000000137146 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2910  transcription elongation factor NusA  40.44 
 
 		 538 aa  326  6e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3349  transcription elongation factor NusA  38.64 
 
 		 497 aa  320  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42830  transcription elongation factor NusA  40.08 
 
 		 493 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2044  transcription elongation factor NusA  46.11 
 
 		 383 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1152  transcription elongation factor NusA  46.67 
 
 		 382 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162475  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3609  transcription elongation factor NusA  39.92 
 
 		 493 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07820  NusA antitermination factor  44.44 
 
 		 377 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2412  transcription elongation factor NusA  39.95 
 
 		 441 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.659924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0390  transcription termination factor NusA  39.89 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0554  NusA antitermination factor  39.89 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.557873  normal  0.218927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4491  N utilization substance protein A  40.2 
 
 		 493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.119546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4181  transcription elongation factor NusA  40 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0720  transcription elongation factor NusA  40.4 
 
 		 493 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0992944 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3679  NusA antitermination factor  44.74 
 
 		 493 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0562  transcription elongation factor NusA  37.78 
 
 		 503 aa  312  9e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1665  NusA antitermination factor  44.08 
 
 		 365 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000721447  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4713  transcription elongation factor NusA  39.6 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1432  NusA antitermination factor  45.3 
 
 		 373 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000109855  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1691  transcription elongation factor NusA  37.76 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.349056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5463  transcription elongation factor NusA  38.72 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62770  transcription elongation factor NusA  38.72 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4578  transcription elongation factor NusA  39.6 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00867288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1601  transcription elongation factor NusA  37.43 
 
 		 503 aa  311  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.468238  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4713  transcription elongation factor NusA  39.21 
 
 		 493 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0666  NusA antitermination factor  38.53 
 
 		 463 aa  310  5.9999999999999995e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0123778 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0040  transcription elongation factor NusA  40.83 
 
 		 590 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2453  transcription elongation factor NusA  38.24 
 
 		 490 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000540151  normal  0.905596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0454  NusA antitermination factor  42.44 
 
 		 382 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1316  transcription elongation factor NusA  38.29 
 
 		 499 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1960  transcription elongation factor NusA  44.17 
 
 		 384 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0055359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0724  NusA antitermination factor  38.84 
 
 		 495 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.188433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0778  transcription elongation factor NusA  39.41 
 
 		 493 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311397  normal  0.0634223 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0066  transcription elongation factor NusA  38.17 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000185989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1648  transcription elongation factor NusA  42.47 
 
 		 346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000247005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01759  transcription elongation factor NusA  37.66 
 
 		 498 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1330  transcription elongation factor NusA  43.32 
 
 		 368 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000381059  hitchhiker  0.000133045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2121  transcription elongation factor NusA  37.75 
 
 		 506 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.274581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3075  NusA antitermination factor  41.55 
 
 		 497 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>