More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3813 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3813  ABC transporter related protein  100 
 
 		 642 aa  1277    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.206928  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  44.39 
 
 		 625 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  45.28 
 
 		 602 aa  502  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0160  ABC transporter related  44.48 
 
 		 616 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.11 
 
 		 592 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  42.6 
 
 		 602 aa  476  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 603 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  40.44 
 
 		 622 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3067  ABC transporter related  43.15 
 
 		 621 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.134342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.45 
 
 		 600 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  39.77 
 
 		 592 aa  440  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 594 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  36.36 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 608 aa  426  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 600 aa  428  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  38.04 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  39.62 
 
 		 611 aa  425  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1390  ABC transporter related  39.09 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.838756  normal  0.671981 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  36.78 
 
 		 611 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.16 
 
 		 613 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  37.52 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  36.26 
 
 		 614 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  39.52 
 
 		 610 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36.2 
 
 		 603 aa  412  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  35.3 
 
 		 635 aa  409  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  36.61 
 
 		 619 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 607 aa  405  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  34.88 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  35.55 
 
 		 591 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.77 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  36.17 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 586 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.17 
 
 		 597 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.15 
 
 		 617 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  34.91 
 
 		 588 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  35.67 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  32.51 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 636 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  34.59 
 
 		 623 aa  365  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0881  ATPase  37.76 
 
 		 592 aa  364  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  32.01 
 
 		 584 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  34.39 
 
 		 594 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3376  ABC transporter related  37.46 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2726  ABC transporter related  37.46 
 
 		 610 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.8 
 
 		 614 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3227  ABC transporter-related protein  38.62 
 
 		 675 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.99 
 
 		 608 aa  357  5e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  34.67 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.99 
 
 		 600 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  31.63 
 
 		 598 aa  354  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  35.52 
 
 		 609 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  33.11 
 
 		 587 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0039  putative ATP-binding component of a transport system  36.27 
 
 		 588 aa  351  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0738965  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  32.78 
 
 		 587 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0782  ATPase  37.03 
 
 		 598 aa  350  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  36.57 
 
 		 650 aa  350  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  33.83 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.83 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  33.83 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.83 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  32.78 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  38.3 
 
 		 622 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  34.67 
 
 		 607 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.69 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  36.25 
 
 		 608 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 		 587 aa  344  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 592 aa  344  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  34.53 
 
 		 637 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.5 
 
 		 587 aa  342  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  31.18 
 
 		 594 aa  342  9e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1467  ABC transporter related  36.2 
 
 		 603 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000245046  normal  0.820859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 614 aa  340  4e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  34.88 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06161  putative multidrug efflux ABC transporter  35.93 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.898813  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0968  ATPase  37.2 
 
 		 592 aa  336  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0282  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 600 aa  336  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  32.58 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.99 
 
 		 620 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08241  putative multidrug efflux ABC transporter  37.02 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5995  ABC transporter related  33.6 
 
 		 632 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  33.76 
 
 		 625 aa  333  7.000000000000001e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 		 598 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3035  ABC transporter-like protein protein  34.13 
 
 		 626 aa  333  8e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4342  ABC transporter, transmembrane region  37.27 
 
 		 626 aa  333  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441734  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.68 
 
 		 598 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  33.12 
 
 		 632 aa  332  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05641  putative multidrug efflux ABC transporter  36.03 
 
 		 599 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  31.5 
 
 		 602 aa  330  6e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  33.91 
 
 		 587 aa  330  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.39 
 
 		 594 aa  329  8e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  36.41 
 
 		 610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.68 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  36.23 
 
 		 610 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  36.23 
 
 		 610 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  32.31 
 
 		 609 aa  326  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  32.25 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  31.66 
 
 		 598 aa  325  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.78 
 
 		 597 aa  324  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>