More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3769 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3769  Glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 417 aa  845    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal  0.168004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6691  Glycine hydroxymethyltransferase  67.87 
 
 		 418 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.476522  normal  0.212987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2242  glycine hydroxymethyltransferase  68.52 
 
 		 420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0554627 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1537  serine hydroxymethyltransferase  66.67 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.54072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0231  Glycine hydroxymethyltransferase  67.63 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.681161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1644  serine hydroxymethyltransferase  67.49 
 
 		 420 aa  567  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2509  serine hydroxymethyltransferase  65.05 
 
 		 420 aa  567  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0624  serine hydroxymethyltransferase  65.85 
 
 		 420 aa  556  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.260999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 412 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  58.13 
 
 		 412 aa  484  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  58.52 
 
 		 412 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2187  Glycine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 418 aa  465  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  53.58 
 
 		 412 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  55.8 
 
 		 415 aa  465  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2390  serine hydroxymethyltransferase  59.45 
 
 		 416 aa  461  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0832592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  56.27 
 
 		 411 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.5 
 
 		 416 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  56.61 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 415 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  60 
 
 		 417 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.23 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  55.28 
 
 		 414 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  56.3 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  54.3 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  57.61 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  55.04 
 
 		 415 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 414 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 415 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  54.55 
 
 		 415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  55.36 
 
 		 420 aa  448  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  55.36 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  54.79 
 
 		 415 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  54.73 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 412 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 417 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 419 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  55.11 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 425 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  54.36 
 
 		 417 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1813  serine hydroxymethyltransferase  51.84 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1418  serine hydroxymethyltransferase  55.72 
 
 		 420 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0614522  normal  0.461409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  52.45 
 
 		 412 aa  435  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  53.32 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  53.9 
 
 		 413 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  54.46 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 413 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  53.55 
 
 		 422 aa  437  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  52.87 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  50.74 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  53.73 
 
 		 431 aa  432  1e-120  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  54.48 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  52.87 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  53.79 
 
 		 426 aa  431  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 413 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4027  glycine hydroxymethyltransferase  52.9 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.17117  normal  0.0123375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  53.15 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2316  serine hydroxymethyltransferase  52.7 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  51.95 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  52.93 
 
 		 429 aa  431  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 413 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1155  serine hydroxymethyltransferase  51.4 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0218  serine hydroxymethyltransferase  54.59 
 
 		 419 aa  430  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0240245  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  51.72 
 
 		 427 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1871  Glycine hydroxymethyltransferase  52.31 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0163056  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  52.62 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0791  serine hydroxymethyltransferase  52.45 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0762  serine hydroxymethyltransferase  52.94 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0290  serine hydroxymethyltransferase  51.84 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  51.61 
 
 		 411 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18300  serine hydroxymethyltransferase  55.78 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0624646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  53.12 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  51.33 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 415 aa  428  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3468  serine hydroxymethyltransferase  55.29 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.624379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1557  serine hydroxymethyltransferase  51.69 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  52.68 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  54.61 
 
 		 412 aa  427  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1134  serine hydroxymethyltransferase  58.02 
 
 		 437 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  53.17 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0436  serine hydroxymethyltransferase  51.94 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.083606  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1074  serine hydroxymethyltransferase  53.85 
 
 		 418 aa  421  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.907883  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  50.5 
 
 		 423 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  53.61 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  53.98 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2992  serine hydroxymethyltransferase  53.83 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  0.346056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_378  serine hydroxymethyltransferase  51.46 
 
 		 415 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1617  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 414 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>