More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3746 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3746  ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  130  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.337014  normal  0.406609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  57.81 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  59.38 
 
 		 65 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00601  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0058  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21301  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0330895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1259  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0055  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.487079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  53.85 
 
 		 66 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 94 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1477  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.570064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3447  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  43.08 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1091  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000360763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4310  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  48.44 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  54.69 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  43.75 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0876  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000162638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1142  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000161072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  43.08 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18511  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.428259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0982  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0841883 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18511  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.752965  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18701  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.951627  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1753  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  50.77 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  46.15 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2146  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0725  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00316856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  54.84 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0347  ribosomal protein L35  44.78 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000040469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1312  ribosomal protein L35  46.15 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000103845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0488  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000885309  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  52.46 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  41.54 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>