More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3704 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  100 
 
 
321 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  55.23 
 
 
298 aa  335  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  50.35 
 
 
304 aa  315  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  50.18 
 
 
288 aa  309  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  52.04 
 
 
298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.67 
 
 
318 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  49.45 
 
 
290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1351  lipoyl synthase  50.66 
 
 
315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.264104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  50.66 
 
 
315 aa  305  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  53.26 
 
 
303 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  53.26 
 
 
303 aa  305  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  51.7 
 
 
298 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  50.7 
 
 
292 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  53.41 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  53.41 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  53.41 
 
 
298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  52.86 
 
 
320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  51.04 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  51.29 
 
 
299 aa  304  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  50.86 
 
 
325 aa  304  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50.87 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.17 
 
 
337 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  53.76 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  52.31 
 
 
321 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.36 
 
 
328 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  47.6 
 
 
321 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  51.44 
 
 
298 aa  299  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  51.25 
 
 
321 aa  299  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  299  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  50.9 
 
 
319 aa  298  7e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  49.65 
 
 
321 aa  298  8e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  50.88 
 
 
321 aa  298  9e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  55.32 
 
 
322 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  297  1e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  49.14 
 
 
304 aa  296  5e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  51.6 
 
 
321 aa  295  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  48.08 
 
 
297 aa  295  8e-79  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  51.43 
 
 
339 aa  295  8e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  48.99 
 
 
302 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  49.31 
 
 
320 aa  294  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  51.43 
 
 
318 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.88 
 
 
325 aa  294  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  48.36 
 
 
290 aa  293  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  50.72 
 
 
329 aa  293  2e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  47.2 
 
 
299 aa  294  2e-78  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  52.54 
 
 
311 aa  294  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  50.71 
 
 
326 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  50.18 
 
 
324 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  293  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  50.71 
 
 
326 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3156  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000010408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  51.76 
 
 
328 aa  292  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  47.9 
 
 
290 aa  292  4e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  49.83 
 
 
314 aa  292  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  47.14 
 
 
314 aa  292  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  49.82 
 
 
355 aa  291  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6230  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  46.82 
 
 
325 aa  291  9e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1049  lipoyl synthase  50.89 
 
 
321 aa  291  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00710809  hitchhiker  0.0056856 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.4 
 
 
317 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  47.7 
 
 
282 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  47.25 
 
 
322 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3030  lipoyl synthase  48.93 
 
 
322 aa  290  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.464318  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0217  lipoyl synthase  49.65 
 
 
334 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  290  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  48.11 
 
 
305 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2888  lipoyl synthase  51.25 
 
 
319 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  51.25 
 
 
321 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  50.54 
 
 
325 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  48.11 
 
 
305 aa  290  2e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0417  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.297091  normal  0.190566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1161  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  290  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4212  lipoyl synthase  50.71 
 
 
334 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.740031 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  49.29 
 
 
320 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2272  lipoyl synthase  50.71 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0984  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.10688  normal  0.0219109 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2887  lipoyl synthase  50.71 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0988  lipoyl synthase  50.53 
 
 
321 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0584288  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2857  lipoyl synthase  50.89 
 
 
319 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.116135  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2897  lipoyl synthase  50.35 
 
 
330 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1553  lipoyl synthase  49.47 
 
 
320 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.108222  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0504  lipoyl synthase  50 
 
 
335 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0591731 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  49.47 
 
 
321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2572  lipoyl synthase  49.5 
 
 
319 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.085231  normal  0.78924 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  50 
 
 
304 aa  289  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.36 
 
 
330 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2937  lipoyl synthase  50.36 
 
 
330 aa  288  8e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  50.18 
 
 
321 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  50.18 
 
 
321 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>