195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3676 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  100 
 
 
886 aa  1657    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.96 
 
 
958 aa  139  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.74 
 
 
1343 aa  130  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.23 
 
 
510 aa  128  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  30.27 
 
 
1094 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.47 
 
 
1438 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.16 
 
 
1148 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.34 
 
 
1224 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.47 
 
 
395 aa  111  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  32.92 
 
 
546 aa  110  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.63 
 
 
1181 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.76 
 
 
180 aa  102  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.5 
 
 
493 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.65 
 
 
524 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 
593 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.16 
 
 
670 aa  97.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.9 
 
 
1412 aa  92  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.4 
 
 
192 aa  91.3  7e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.62 
 
 
208 aa  89.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28 
 
 
666 aa  88.6  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  30.2 
 
 
644 aa  87.8  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 
490 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.67 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.07 
 
 
390 aa  80.5  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.94 
 
 
667 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.08 
 
 
370 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.01 
 
 
232 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  24.39 
 
 
959 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.23 
 
 
1139 aa  78.2  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.96 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.33 
 
 
157 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.9 
 
 
431 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.59 
 
 
1328 aa  77  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.57 
 
 
399 aa  76.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.47 
 
 
321 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  28.99 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  33.73 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.11 
 
 
646 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  27.35 
 
 
646 aa  73.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.26 
 
 
323 aa  73.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.53 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  41.67 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.31 
 
 
251 aa  72  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  31.97 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.52 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.97 
 
 
223 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  33.15 
 
 
325 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.19 
 
 
173 aa  68.9  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.53 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.58 
 
 
408 aa  67  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  35.75 
 
 
321 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.03 
 
 
1133 aa  65.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  32 
 
 
1216 aa  65.1  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.6 
 
 
331 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.76 
 
 
408 aa  63.9  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.59 
 
 
234 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  28.69 
 
 
321 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
302 aa  63.9  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.65 
 
 
319 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.65 
 
 
319 aa  63.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
831 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 
668 aa  62.4  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 
313 aa  62.8  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.46 
 
 
215 aa  61.6  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  38.51 
 
 
321 aa  61.2  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.78 
 
 
325 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 
331 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.51 
 
 
334 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  34.23 
 
 
428 aa  61.2  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  24.72 
 
 
838 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.55 
 
 
197 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  29.58 
 
 
316 aa  60.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.94 
 
 
214 aa  60.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.95 
 
 
320 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  27.93 
 
 
643 aa  60.1  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1905  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.78 
 
 
415 aa  60.1  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  33.03 
 
 
299 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.67 
 
 
642 aa  59.3  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.34 
 
 
557 aa  58.9  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.14 
 
 
157 aa  58.9  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.37 
 
 
303 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.95 
 
 
223 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  34.88 
 
 
323 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.13 
 
 
178 aa  57.8  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.27 
 
 
334 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.38 
 
 
331 aa  57.4  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.18 
 
 
1041 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  29.02 
 
 
286 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  27.12 
 
 
199 aa  56.6  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.84 
 
 
690 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
221 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  30.45 
 
 
1194 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.97 
 
 
641 aa  55.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.63 
 
 
773 aa  56.2  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.27 
 
 
331 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  34.27 
 
 
331 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  29.55 
 
 
361 aa  55.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.3 
 
 
168 aa  55.5  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.71 
 
 
326 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.19 
 
 
333 aa  55.5  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>