More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3666 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3666  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 226 aa  463  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.408922  decreased coverage  0.0000749166 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0769  Rhs element Vgr protein  34.45 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0983  hypothetical protein  36.89 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3665  Rhs element Vgr protein  38.7 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  hitchhiker  0.000248141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1509  Rhs element Vgr protein  34.62 
 
 		 239 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3684  Rhs element Vgr protein  35.61 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.149401  hitchhiker  0.000521794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1663  Rhs element Vgr protein  34.27 
 
 		 589 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485896  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1953  Rhs element Vgr protein  43.09 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1626  Rhs element Vgr protein  31.7 
 
 		 592 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0131276 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2817  Rhs element Vgr protein  34.1 
 
 		 593 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1732  Rhs element Vgr protein  33.48 
 
 		 641 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520263 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3822  Rhs element Vgr protein  31.72 
 
 		 578 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0443202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1906  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 606 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194585  hitchhiker  0.0014616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3043  Rhs element Vgr protein  31.82 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000160638 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3155  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 		 581 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1051  Rhs element Vgr protein  30.08 
 
 		 594 aa  89.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0926  Rhs element Vgr protein  30.63 
 
 		 587 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.91076  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3609  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 		 574 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1682  Rhs element Vgr protein  30.25 
 
 		 589 aa  86.3  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2550  Rhs element Vgr protein  29.58 
 
 		 589 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1042  phosphoserine phosphatase SerB  28.08 
 
 		 565 aa  84.3  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5384  Rhs element Vgr protein  28.77 
 
 		 602 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2267  Rhs element Vgr protein  31.47 
 
 		 610 aa  79.7  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.267374  hitchhiker  0.000675551 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2555  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  79.3  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000216389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1726  Rhs element Vgr protein  26.36 
 
 		 642 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5894  Rhs element Vgr protein  30.49 
 
 		 615 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  26.82 
 
 		 669 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3260  Rhs element Vgr protein  30.37 
 
 		 602 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0660  hypothetical protein  30.21 
 
 		 605 aa  75.9  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.279373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 668 aa  75.9  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  25.11 
 
 		 668 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0676  Rhs element Vgr protein  25.11 
 
 		 596 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  25.91 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0369  Rhs element Vgr protein  25.21 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4864  Rhs element Vgr protein  31.54 
 
 		 599 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0846936  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1138  hypothetical protein  26.22 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3003  Rhs element Vgr protein  25.57 
 
 		 598 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6416  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 617 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2945  Rhs element Vgr protein  36.67 
 
 		 589 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1781  hypothetical protein  26.94 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0669  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 576 aa  71.6  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26590  hypothetical protein  31.02 
 
 		 599 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0848935  normal  0.672502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2462  hypothetical protein  25.95 
 
 		 595 aa  71.6  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4390  Rhs element Vgr protein  27.95 
 
 		 652 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.86257  normal  0.698434 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1875  hypothetical protein  27.37 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.133633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  35.65 
 
 		 851 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  37.82 
 
 		 646 aa  68.6  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1796  Rhs element Vgr protein  29.15 
 
 		 619 aa  68.6  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1868  hypothetical protein  33.33 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5250  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 596 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012293 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1538  two component LuxR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 621 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  29.05 
 
 		 853 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000029  hypothetical protein  28.57 
 
 		 611 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0043  Rhs element Vgr protein  25.79 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1080  hypothetical protein  25.15 
 
 		 599 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  31.58 
 
 		 697 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3927  Rhs element Vgr protein  27.33 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00332693  hitchhiker  0.00450013 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  27.17 
 
 		 871 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  27.51 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2959  hypothetical protein  30.17 
 
 		 644 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 869 aa  63.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  25.58 
 
 		 875 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  26.2 
 
 		 697 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3558  type VI secretion system Vgr family protein  30.17 
 
 		 782 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125148  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  24.87 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3429  Rhs element Vgr protein  30.17 
 
 		 782 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3931  Rhs element Vgr protein  28.27 
 
 		 616 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.410968  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  33.04 
 
 		 780 aa  62.4  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1748  hypothetical protein  25.88 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.499382  normal  0.986681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  31.09 
 
 		 852 aa  62  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  33.93 
 
 		 911 aa  61.6  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  25.45 
 
 		 477 aa  62  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  26.7 
 
 		 617 aa  61.6  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.27 
 
 		 957 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  30.43 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  24.87 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  28.4 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4953  type VI secretion system Vgr family protein  26.05 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.836014 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.58 
 
 		 1114 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 727 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28.14 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  26.28 
 
 		 769 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  25.34 
 
 		 847 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  30.77 
 
 		 850 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  25 
 
 		 587 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  25.34 
 
 		 690 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0663  hypothetical protein  24.48 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3342  Rhs element Vgr protein  23.94 
 
 		 706 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  30.84 
 
 		 735 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5025  Rhs element Vgr protein  23.94 
 
 		 706 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  26.18 
 
 		 617 aa  58.9  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  26.13 
 
 		 895 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5259  type VI secretion system Vgr family protein  24.02 
 
 		 706 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  24.56 
 
 		 615 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6212  type VI secretion system Vgr family protein  28.21 
 
 		 716 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3589  Rhs element Vgr protein  20.4 
 
 		 612 aa  58.5  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.512863 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  28.33 
 
 		 855 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0853  hypothetical protein  23.96 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  29.73 
 
 		 641 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>