More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3637 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0546  excinuclease ABC, A subunit  39.77 
 
 		 946 aa  650    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0457921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2758  excinuclease ABC family protein  46.6 
 
 		 1855 aa  1512    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3325  excinuclease ABC, A subunit  39.28 
 
 		 937 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0483  excinuclease ABC subunit A  39.67 
 
 		 944 aa  640    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000649364 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2036  Excinuclease ABC subunit A  39.33 
 
 		 944 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0663505  hitchhiker  0.000130956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5952  excinuclease ABC, A subunit  43.74 
 
 		 1984 aa  1476    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5541  excinuclease ABC, A subunit  44.75 
 
 		 1974 aa  1431    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0115667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2429  excinuclease ABC, A subunit  39.75 
 
 		 931 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0994  excinuclease ABC subunit A  45.09 
 
 		 1945 aa  1496    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0618908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4574  excinuclease ABC, A subunit  43.4 
 
 		 1949 aa  1481    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.479669 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3028  excinuclease ABC, A subunit  45.33 
 
 		 1976 aa  1490    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500259  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1339  excinuclease ABC, A subunit  39.04 
 
 		 918 aa  684    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1820  excinuclease ABC subunit A  39.51 
 
 		 954 aa  651    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.315317  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0885  excinuclease ABC, A subunit  39.43 
 
 		 947 aa  682    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5015  excinuclease ABC subunit A  37.95 
 
 		 958 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.93666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4844  excinuclease ABC subunit A  37.95 
 
 		 958 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4859  excinuclease ABC subunit A  37.95 
 
 		 958 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0074  excinuclease ABC, A subunit  44.92 
 
 		 1970 aa  1416    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.862604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0062  excinuclease ABC, subunit A, form 2  44.92 
 
 		 1970 aa  1416    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0294  excinuclease ABC, A subunit  40.55 
 
 		 946 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0512  excinuclease ABC subunit A  39.78 
 
 		 944 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3553  excinuclease ABC, A subunit  39.44 
 
 		 935 aa  689    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5328  excinuclease ABC subunit A  38.05 
 
 		 958 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2024  excinuclease ABC subunit A  40.55 
 
 		 945 aa  647    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136428  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0411  excinuclease ABC, A subunit  40.6 
 
 		 957 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0304  excinuclease ABC, A subunit  43.88 
 
 		 2005 aa  1453    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4240  UvrA family protein  44.78 
 
 		 1957 aa  1452    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.591545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2710  excinuclease ABC subunit A  38.01 
 
 		 1008 aa  642    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00698098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0073  excinuclease ABC, A subunit  45.02 
 
 		 1997 aa  1425    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4192  excinuclease ABC, A subunit  45.45 
 
 		 1935 aa  1436    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000700694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1568  excinuclease ABC, subunit A, form 2  45.02 
 
 		 1971 aa  1426    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0078  excinuclease ABC subunit A  45.02 
 
 		 1867 aa  1503    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5051  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 944 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0371407 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0037  excinuclease ABC subunit A  38.06 
 
 		 920 aa  642    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7351  UvrA family protein  44.65 
 
 		 1967 aa  1451    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.965085  normal  0.937028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1207  excinuclease ABC, A subunit  39.13 
 
 		 952 aa  671    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143233 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0539  excinuclease ABC subunit A  41.03 
 
 		 956 aa  688    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.111546  normal  0.557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1301  excinuclease ABC subunit A  39.22 
 
 		 942 aa  681    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0780  excinuclease ABC, A subunit  40.02 
 
 		 948 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0344359  normal  0.338126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0128  excinuclease ABC subunit A  39.41 
 
 		 937 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2580  UvrA family protein  44.95 
 
 		 1892 aa  1458    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.603689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2709  excinuclease ABC, A subunit  43.38 
 
 		 1995 aa  1450    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.350248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0455  excinuclease ABC subunit A  39.75 
 
 		 916 aa  663    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0811639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5395  excinuclease ABC subunit A  37.95 
 
 		 958 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1084  excinuclease ABC, A subunit  38.15 
 
 		 936 aa  636    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.293507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0366  excinuclease ABC subunit A  37.39 
 
 		 941 aa  637    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1218  excinuclease ABC, subunit A, form 2  44.92 
 
 		 1970 aa  1416    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.13215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0206  excinuclease ABC, A subunit  38.67 
 
 		 947 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000261219  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0440  excinuclease ABC subunit A  39.77 
 
 		 916 aa  664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.674144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0255  excinuclease ABC subunit A  41.23 
 
 		 971 aa  644    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0075  excinuclease ABC, subunit A, form 2  44.69 
 
 		 2021 aa  1433    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5251  excinuclease ABC subunit A  37.95 
 
 		 958 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2119  excinuclease ABC, A subunit  37.3 
 
 		 942 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0488  excinuclease ABC, A subunit  43.41 
 
 		 1965 aa  1148    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1053  excinuclease ABC, A subunit  37.38 
 
 		 927 aa  643    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00826345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3814  excinuclease ABC, A subunit  40.59 
 
 		 2098 aa  1094    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0516  excinuclease ABC subunit A  39.57 
 
 		 944 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567244  normal  0.0841787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4702  excinuclease ABC, A subunit  43.76 
 
 		 1981 aa  1458    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4139  UvrA family protein  43.15 
 
 		 2024 aa  1150    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.79148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3001  UvrA family protein  44.4 
 
 		 1971 aa  1452    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3709  excinuclease ABC subunit A  38.27 
 
 		 956 aa  643    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1158  excinuclease ABC subunit A  39.38 
 
 		 941 aa  690    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1617  excinuclease ABC subunit A  37.39 
 
 		 941 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2176  excinuclease ABC, A subunit  42.31 
 
 		 1840 aa  1340    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1549  excinuclease ABC, A subunit  44.33 
 
 		 1997 aa  1454    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4549  excinuclease ABC subunit A  44.61 
 
 		 1959 aa  1462    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.179328 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0495  excinuclease ABC, A subunit  41.71 
 
 		 952 aa  692    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2022  excinuclease ABC subunit A  40.99 
 
 		 973 aa  723    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3747  UvrA family protein  45.38 
 
 		 1941 aa  1491    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5608  excinuclease ABC, A subunit  45.12 
 
 		 1964 aa  1449    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3878  excinuclease ABC subunit A  39.98 
 
 		 946 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.847875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0522  excinuclease ABC subunit A  39.26 
 
 		 944 aa  645    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0045705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1438  excinuclease ABC, A subunit  44.26 
 
 		 1983 aa  1446    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.836359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3698  excinuclease ABC subunit A  38.24 
 
 		 944 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1444  excinuclease ABC, A subunit  45.46 
 
 		 1889 aa  1441    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0226  hypothetical protein  37.06 
 
 		 935 aa  669    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.544357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4509  excinuclease ABC, A subunit  36.27 
 
 		 943 aa  643    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0677  excinuclease ABC, A subunit  39.15 
 
 		 956 aa  660    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0725474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4720  excinuclease ABC subunit A  39.88 
 
 		 944 aa  644    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.207707 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1437  excinuclease ABC, A subunit  38.25 
 
 		 942 aa  658    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4341  excinuclease ABC, A subunit  44.18 
 
 		 1969 aa  1462    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.580395 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6248  excinuclease ABC, A subunit  44.87 
 
 		 1996 aa  1464    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5945  excinuclease ABC, A subunit  44.77 
 
 		 1996 aa  1457    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1501  excinuclease ABC, subunit A, form 2  44.92 
 
 		 1970 aa  1416    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.776377  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3346  UvrA family protein  45.58 
 
 		 1929 aa  1457    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.973275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0189  excinuclease ABC, A subunit  38.46 
 
 		 947 aa  638    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0119000000000001e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16220  excinuclease ABC, A subunit  38.73 
 
 		 941 aa  644    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266346  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2246  excinuclease ABC, A subunit  47.19 
 
 		 1896 aa  1454    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186636  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5972  excinuclease ABC, A subunit  45.12 
 
 		 1964 aa  1449    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0125228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0731  excinuclease ABC, A subunit  43.68 
 
 		 1895 aa  897    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1602  excinuclease ABC, A subunit  43.26 
 
 		 874 aa  638    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2991  excinuclease ABC subunit A  38.91 
 
 		 954 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.9416  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6472  excinuclease ABC, A subunit  45.09 
 
 		 1964 aa  1452    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225819 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4441  excinuclease ABC, A subunit  43.4 
 
 		 1949 aa  1481    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.407349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0375  excinuclease ABC, A subunit  39.61 
 
 		 954 aa  653    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00180738  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0831  excinuclease ABC, A subunit  40.1 
 
 		 948 aa  666    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0795854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1939  excinuclease ABC subunit A  39.59 
 
 		 950 aa  666    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0317613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1703  excinuclease ABC subunit A  38.08 
 
 		 949 aa  647    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0110  excinuclease ABC, A subunit  46.17 
 
 		 2017 aa  1152    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4379  excinuclease ABC, A subunit  36.96 
 
 		 962 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>