80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3635 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  100 
 
 		 131 aa  261  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  41.32 
 
 		 123 aa  98.6  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  43.7 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  42.97 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  40.32 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  41.67 
 
 		 143 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  39.5 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  39.83 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  39.83 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  35.38 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  36.89 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  44.12 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  35.25 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  35 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  33.33 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  33.33 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  33.59 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  32.5 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  36.15 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  29.91 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  32.58 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  34.48 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  38.21 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  34.75 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  34.29 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  32.58 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  40.59 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1388  DoxX family protein  31.5 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  38.38 
 
 		 198 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0945  DoxX family protein  30.66 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1832  DoxX family protein  38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.174691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3233  DoxX family protein  33.33 
 
 		 405 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  31.85 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  33.09 
 
 		 144 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  40 
 
 		 197 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2953  DoxX  30.28 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  40 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  35 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  32.58 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  31.82 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  30.77 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0499  DoxX family protein  31.2 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0660687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  33.09 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2878  DoxX  33.86 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2947  DoxX family protein  36.89 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.12 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  37.4 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  38.89 
 
 		 197 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8175  DoxX family protein  33.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  34.29 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  30.08 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1443  DoxX  34.69 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  35.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0687  DoxX  31.78 
 
 		 134 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  30.65 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  33.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2375  DoxX family protein  38.89 
 
 		 197 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal  0.888641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0428  DoxX family protein  30.08 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0401173  normal  0.859055 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  30.92 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  31.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  33.86 
 
 		 182 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1627  DoxX  30.3 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109453  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  30.08 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  28.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0038  DoxX family protein  30.65 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0462  DoxX family protein  29.27 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0742916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.61 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0684  DoxX  29.55 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000000773987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13020  hypothetical protein  29.86 
 
 		 279 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.923899  normal  0.136283 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  28.33 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.07 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2914  DoxX family protein  40.48 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0156425  normal  0.195478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  30.6 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  33.33 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  33.33 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  39.44 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  30.77 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  38.96 
 
 		 148 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>