More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3619 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3619  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 234 aa  464  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0594601  decreased coverage  0.000131742 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4190  pentapeptide repeat-containing protein  27.04 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 881 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.23 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.37 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  32.75 
 
 		 456 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  29.41 
 
 		 225 aa  72  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.88 
 
 		 567 aa  71.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  27.36 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  28.25 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 		 441 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  28.65 
 
 		 846 aa  68.9  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  23.85 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  23.85 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 		 319 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  31.22 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  29.29 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  27 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  32.28 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  27.52 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  24.44 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  28.88 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  28.06 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  30.62 
 
 		 872 aa  61.6  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  27.64 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  29.69 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  27.71 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  27.06 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  31.96 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  27.7 
 
 		 844 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  27.66 
 
 		 862 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  29.52 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0724  hypothetical protein  30.81 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0543  hypothetical protein  30.81 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  28.7 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  30.17 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1682  hypothetical protein  30.81 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  24.87 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0613  hypothetical protein  30.81 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.205681  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2132  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.855918  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0861  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0186818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 		 776 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 521 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  30.96 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  25.73 
 
 		 710 aa  59.3  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  24.86 
 
 		 401 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2034  pentapeptide repeat-containing protein  30.81 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 489 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  29.58 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.02 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  36 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  25.93 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1294  serine/threonine protein kinase  33.91 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  28.73 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  30.29 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  28.26 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  28 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  31.36 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.22 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  32.84 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  26.77 
 
 		 886 aa  57.4  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  29.92 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  26.7 
 
 		 245 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  29.89 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  26.79 
 
 		 363 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.9 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.71 
 
 		 949 aa  57  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0253  pentapeptide repeat-containing protein  28.11 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  30.22 
 
 		 416 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.94 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3456  pentapeptide repeat protein  28.12 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.651627 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1899  hypothetical protein  28.11 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1705  pentapeptide repeat-containing protein  28.11 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  23.37 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1197  hypothetical protein  28.11 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  25.5 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0910  hypothetical protein  28.11 
 
 		 360 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1275  pentapeptide repeat protein  27.33 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  26.43 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  26.5 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  27.18 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  27.07 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  25.86 
 
 		 447 aa  55.1  0.0000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  26.02 
 
 		 517 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>