More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3603 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3603  Methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000473766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  36.32 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3665  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
251 aa  88.6  9e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  40.11 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0952  methyltransferase type 11  37.63 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_4907  predicted protein  31.76 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.27365  normal  0.859905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 
207 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2733  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
506 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122913  normal  0.460433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46770  predicted protein  33.74 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.97 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.1 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  44.79 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.14 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.96 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0114  hypothetical protein  38.78 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  37.63 
 
 
202 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.07 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  39 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  35 
 
 
284 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 
441 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  34.55 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
199 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 
260 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  34.91 
 
 
441 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31705  predicted protein  32.91 
 
 
163 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.592624  normal  0.0686433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.14 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  30.27 
 
 
301 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  37.37 
 
 
209 aa  63.2  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1355  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
220 aa  62.8  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.632641  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
411 aa  62.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.8 
 
 
212 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  34.06 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
238 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
240 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  34 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
200 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 
200 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  33.56 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0377  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.790599  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  35.25 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  40.86 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  43.53 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  29.81 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1029  methyltransferase type 11  33.79 
 
 
210 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  31.74 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  34 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  37.89 
 
 
287 aa  61.2  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.17 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0691  Methyltransferase type 11  36.24 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.484413  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
236 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 
320 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  36.21 
 
 
269 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
324 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  32.37 
 
 
325 aa  60.1  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  37.96 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  31.25 
 
 
658 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
206 aa  60.1  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  36.51 
 
 
305 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0692  Methyltransferase type 11  35.1 
 
 
205 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.283782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.24 
 
 
241 aa  59.7  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
219 aa  59.7  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.62 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 
270 aa  58.9  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  30.58 
 
 
309 aa  58.9  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.95 
 
 
213 aa  58.9  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  33.11 
 
 
307 aa  58.9  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  27.33 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  36.73 
 
 
256 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.66 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.69 
 
 
447 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
207 aa  58.5  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.05 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
275 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 
230 aa  58.5  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>