More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3592 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3592  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 
314 aa  642    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  hitchhiker  0.00183471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2443  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  59.45 
 
 
297 aa  361  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1838  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  56.16 
 
 
299 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.611608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2214  pyruvate carboxyltransferase  58.94 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.893869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2302  pyruvate carboxyltransferase  58.55 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.895506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1644  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  58.22 
 
 
314 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2166  pyruvate carboxyltransferase  55.63 
 
 
315 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349965  normal  0.754969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1805  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0421584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2358  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.22 
 
 
303 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2514  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  322  6e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2551  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.694334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2372  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2288  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2550  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2606  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.22 
 
 
303 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.185638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2563  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.56 
 
 
303 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.5413e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2809  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.88 
 
 
303 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154528 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2330  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.22 
 
 
303 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.566352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2929  pyruvate carboxyltransferase  52.49 
 
 
305 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0756431  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3654  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.49 
 
 
299 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1542  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.131196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1599  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.2 
 
 
308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0633  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.48 
 
 
299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1358  pyruvate carboxyltransferase  48.98 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49510  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.83 
 
 
300 aa  301  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00876047  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05920  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.02 
 
 
314 aa  301  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1943  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.46 
 
 
299 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483934  hitchhiker  0.000417953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2384  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.62 
 
 
299 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.953332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.62 
 
 
299 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2234  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.28 
 
 
299 aa  298  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2574  pyruvate carboxyltransferase  51.09 
 
 
301 aa  298  1e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2029  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.98 
 
 
299 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0062803  normal  0.740342 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2802  pyruvate carboxyltransferase  48.82 
 
 
301 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2471  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.46 
 
 
299 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1975  pyruvate carboxyltransferase  53.4 
 
 
309 aa  296  4e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3824  pyruvate carboxyltransferase  48.83 
 
 
302 aa  295  8e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3293  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  51.32 
 
 
309 aa  295  9e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1800  pyruvate carboxyltransferase  50.87 
 
 
298 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0874728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3278  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.9 
 
 
300 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2742  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.46 
 
 
299 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02416  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.81 
 
 
298 aa  293  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3227  pyruvate carboxyltransferase  48.14 
 
 
296 aa  292  4e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.461669  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1526  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 
307 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2977  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 
307 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2832  pyruvate carboxyltransferase  48.3 
 
 
307 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1454  pyruvate carboxyltransferase  47.47 
 
 
296 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.119329  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1893  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.37 
 
 
315 aa  289  3e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2152  pyruvate carboxyltransferase  51.01 
 
 
298 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2850  pyruvate carboxyltransferase  47.96 
 
 
307 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2126  pyruvate carboxyltransferase  50.73 
 
 
299 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.129667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38490  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.01 
 
 
300 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1668  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.18 
 
 
310 aa  289  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2326  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.82 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.43357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6411  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase  51.19 
 
 
315 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565607 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2398  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.82 
 
 
315 aa  288  7e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1794  hypothetical protein  45.92 
 
 
302 aa  287  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2731  pyruvate carboxyltransferase  48.46 
 
 
296 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000381  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  52.61 
 
 
309 aa  286  2e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0753  pyruvate carboxyltransferase  48.34 
 
 
311 aa  286  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1854  pyruvate carboxyltransferase  51.69 
 
 
301 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.41694  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1715  pyruvate carboxyltransferase  50.37 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1793  hypothetical protein  45.61 
 
 
302 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0124  pyruvate carboxyltransferase  49.16 
 
 
305 aa  286  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0086  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50 
 
 
301 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  53.43 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.284878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0816  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 
304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4905  pyruvate carboxyltransferase  49.48 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41695  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1888  pyruvate carboxyltransferase  52.57 
 
 
306 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2250  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.42 
 
 
295 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2780  pyruvate carboxyltransferase  49.49 
 
 
301 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262601  normal  0.241199 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05477  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  49.45 
 
 
298 aa  280  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4349  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  48.01 
 
 
303 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0149  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.34 
 
 
315 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.26457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0040  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.53 
 
 
287 aa  278  6e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00102  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.52 
 
 
298 aa  278  9e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.135051  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2053  pyruvate carboxyltransferase  50.18 
 
 
301 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00230012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0026  pyruvate carboxyltransferase  48.81 
 
 
303 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0607  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.36 
 
 
310 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314247  normal  0.692973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0348  pyruvate carboxyltransferase  50 
 
 
315 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6387  pyruvate carboxyltransferase  48.66 
 
 
309 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0160856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5964  pyruvate carboxyltransferase  45.72 
 
 
313 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0367175  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4125  pyruvate carboxyltransferase  48.81 
 
 
313 aa  275  6e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0353  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 
311 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0543  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 
311 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0367  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.48 
 
 
311 aa  275  9e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.128401  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0477  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2115  pyruvate carboxyltransferase  46.15 
 
 
306 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.348555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3038  pyruvate carboxyltransferase  45.7 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.928882  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0032  pyruvate carboxyltransferase  51.19 
 
 
303 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624868  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3641  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  50.19 
 
 
289 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.520749  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3757  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.36 
 
 
304 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0122709  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0514  pyruvate carboxyltransferase  48.24 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00792422  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4049  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.33 
 
 
303 aa  272  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0594588  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4049  pyruvate carboxyltransferase  50.84 
 
 
360 aa  272  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651223  normal  0.299101 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0153  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.67 
 
 
311 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0343  pyruvate carboxyltransferase  46.38 
 
 
306 aa  271  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3783  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.17 
 
 
319 aa  271  1e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0401  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  47.97 
 
 
309 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.828633  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0312  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  45.72 
 
 
306 aa  271  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001540  hydroxymethylglutaryl-CoA lyase  46.37 
 
 
302 aa  270  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>