13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3560 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3560  PEGA domain protein  100 
 
 		 361 aa  720    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00097994  normal  0.106355 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3774  PEGA domain-containing protein  28.64 
 
 		 317 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3789  PEGA domain protein  28.47 
 
 		 338 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518163  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4980  hypothetical protein  26.62 
 
 		 359 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.514194  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  34.33 
 
 		 930 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3706  PEGA domain protein  27.78 
 
 		 338 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3648  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 334 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0366403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 775 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6451  Tetratricopeptide TPR_4  31.33 
 
 		 282 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  30 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  26.57 
 
 		 592 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6756  hypothetical protein  34.21 
 
 		 342 aa  42.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>