204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3559 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3559  DNA repair protein RecO  100 
 
 		 275 aa  539  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.030198  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0929  DNA repair protein RecO  33.07 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000628388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12480  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2557  DNA repair protein RecO  39.76 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.105243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2653  DNA repair protein RecO  40.32 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1303  DNA replication and repair protein RecO  44.2 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0580  recombination protein RecO  30.7 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_519  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  28.95 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000908195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0553  DNA repair protein RecO  30.13 
 
 		 253 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0577  DNA repair protein RecO  34.4 
 
 		 243 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1301  DNA repair protein RecO  34.9 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2462  DNA repair protein RecO  38.28 
 
 		 256 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.762702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3482  recombination protein O, RecO  28.05 
 
 		 250 aa  92.8  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.531591  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3103  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1657  DNA repair protein RecO  33.2 
 
 		 266 aa  92.4  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.887062  hitchhiker  0.0015865 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2419  DNA repair protein RecO  26.21 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2943  recombination protein O, RecO  29.48 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661393  hitchhiker  0.00131296 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0581  DNA repair protein RecO  25.58 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1193  DNA repair protein RecO  29.88 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1066  DNA replication and repair protein RecO  26.15 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0725  DNA repair protein RecO  26.56 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.191921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1031  DNA repair protein RecO  30.73 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2708  DNA repair protein RecO  29.41 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00607294  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1410  DNA repair protein RecO  36.3 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000007948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0597  RecO-domain-containing DNA repair protein  33.15 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000273743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4273  DNA repair protein RecO  30 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2883  DNA repair protein RecO  33.06 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.108982  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1930  DNA repair protein RecO  36.26 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2799  DNA repair protein RecO  28.79 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2800  DNA repair protein RecO  28.97 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3024  DNA repair protein RecO  27.27 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.42951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1709  DNA repair protein RecO  26.95 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1735  DNA repair protein RecO  29.37 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.219442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4149  DNA repair protein RecO  30.51 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0297878  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1504  DNA repair protein RecO  32.02 
 
 		 248 aa  79  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0430427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1346  DNA repair protein RecO  24.14 
 
 		 248 aa  78.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000264775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0483  DNA repair protein RecO  31.56 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.392891  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1206  DNA repair protein RecO  30.9 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0262183  normal  0.203633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0821  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000159175  decreased coverage  1.09268e-22 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0764  DNA repair protein RecO  30.94 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.232991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4431  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000532421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4198  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4036  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000824167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4046  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4522  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000535932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4320  DNA repair protein RecO  28.81 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2531e-58 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0601  DNA replication and repair protein RecO  27.78 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1272  DNA repair protein RecO  36.18 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.095491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4415  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000274955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0194  DNA repair protein RecO  25.86 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3375  DNA repair protein RecO  32.8 
 
 		 269 aa  72  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  0.0597768 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2118  DNA repair protein RecO  35.86 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7039  DNA repair protein RecO  30.11 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0406  DNA repair protein RecO  32.69 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000965492  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1857  DNA repair protein RecO  30.56 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00420864  normal  0.0151714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4378  DNA repair protein RecO  28.25 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000495524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1663  DNA repair protein RecO  30.2 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.250893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2475  DNA repair protein RecO  25.2 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000834216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0852  DNA repair protein RecO  33.7 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352076  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1979  DNA repair protein RecO  32.98 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1411  DNA repair protein RecO  26.26 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000257171  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0729  DNA repair protein RecO  32.24 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2832  DNA repair protein RecO  28.49 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0818902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1176  DNA repair protein RecO  33.7 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0729  DNA repair protein RecO  34.25 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17140  DNA replication and repair protein RecO  32.62 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.136708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3527  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4604  DNA repair protein RecO  27.03 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.643517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3062  DNA repair protein RecO  27.53 
 
 		 244 aa  67  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  decreased coverage  0.0000000887022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2590  DNA repair protein RecO  31.58 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.466675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1962  DNA repair protein RecO  31.28 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000273379 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2189  DNA repair protein RecO  32.04 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.577631  normal  0.126644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1732  DNA repair protein RecO  30.95 
 
 		 286 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.467987  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13550  DNA replication and repair protein RecO  31.87 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.179739 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1969  recombination protein O, RecO  29.47 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2757  DNA repair protein RecO  33.15 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2556  DNA repair protein RecO  23.17 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3447  DNA repair protein RecO  32.63 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3232  DNA repair protein RecO  32.22 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0497306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0801  DNA repair protein RecO  23.02 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3826  DNA repair protein RecO  32.11 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2799  DNA repair protein RecO  28.03 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.428956  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1558  DNA repair protein (recombination protein O)  25.77 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1117  recombinational DNA repair protein (RecF pathway)  25.51 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl267  DNA repair/recombination protein  22.1 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000227319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0545  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2893  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1087  DNA repair protein RecO  32.34 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2464  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2817  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2777  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2838  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1787  DNA repair protein RecO  30.72 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.806002  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2539  DNA repair protein RecO  26.24 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0978  DNA repair protein RecO  29.68 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2335  DNA replication and repair protein RecO  32.04 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2225  DNA repair protein RecO  28.89 
 
 		 256 aa  62.4  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.412691  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1539  DNA repair protein RecO  29.39 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.379083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0909  DNA replication and repair protein RecO  31.52 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2393  DNA repair protein RecO  25.64 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>