187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3526 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3526  OsmC family protein  100 
 
 
177 aa  362  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7407  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2354  OsmC-like protein  52.94 
 
 
170 aa  148  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.572746  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2505  OsmC family protein  47.86 
 
 
147 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3413  OsmC family protein  42.47 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0443  OsmC-like protein  36.97 
 
 
176 aa  111  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0339  OsmC family protein  41.38 
 
 
145 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.53983  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2488  OsmC family protein  42.19 
 
 
172 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0230337  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04790  OsmC family protein  36.23 
 
 
144 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1892  OsmC-like protein  37.91 
 
 
148 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2325  OsmC family protein  37.91 
 
 
180 aa  99  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1026  OsmC family protein  31.93 
 
 
206 aa  96.7  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4895  OsmC-like protein  34.9 
 
 
184 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3268  OsmC family protein  34.9 
 
 
184 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4432  OsmC family protein  39.67 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.670087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3421  OsmC family protein  39.67 
 
 
184 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320541  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0235  OsmC family protein  39.37 
 
 
147 aa  93.2  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1644  OsmC family protein  32.88 
 
 
193 aa  91.3  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4264  hypothetical protein  40.21 
 
 
184 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6912  OsmC family protein  34.23 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0441  OsmC family protein  39.13 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.488218  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4791  OsmC family protein  40 
 
 
187 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.361207  normal  0.435509 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2488  hypothetical protein  36.84 
 
 
202 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2254  OsmC-like protein  32.39 
 
 
199 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0977605  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6160  OsmC family protein  36.75 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.76501  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6453  OsmC family protein  36.75 
 
 
182 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16719  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4241  OsmC family protein  37.19 
 
 
202 aa  85.5  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1670  OsmC family protein  33.07 
 
 
156 aa  85.1  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0539264  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0218  hypothetical protein  62.3 
 
 
74 aa  85.1  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.354041 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6854  OsmC family protein  33.1 
 
 
186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0190  OsmC family protein  35.25 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.155362 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2570  OsmC family protein  31.01 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1348  OsmC family protein  32.84 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1978  OsmC family protein  33.06 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1058  OsmC family protein  36.03 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.333829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1865  OsmC family protein  35.77 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128326  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5247  OsmC family protein  37.74 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.402263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2788  hypothetical protein  36.04 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5957  OsmC family protein  33.06 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2100  OsmC family protein  33.06 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0586  OsmC family protein  29.5 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.128993  normal  0.0133234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1127  OsmC family protein  27.11 
 
 
168 aa  72  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.938023 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1270  hypothetical protein  28.99 
 
 
144 aa  72  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00225413  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0042  OsmC family protein  35.77 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4175  hypothetical protein  32.39 
 
 
135 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214068  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1072  OsmC family protein  34.68 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07015  hypothetical protein  30.08 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6241  OsmC family protein  28.85 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0196837  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2836  OsmC family protein  33.07 
 
 
177 aa  67.8  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1436  OsmC family protein  30.16 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2873  hypothetical protein  30.47 
 
 
405 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.326467  normal  0.0265941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1835  OsmC-like protein  34.45 
 
 
407 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  34.71 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3485  OsmC family protein  34.43 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1727  hypothetical protein  31.58 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1071  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000601559  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1075  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1403  OsmC family protein  33.33 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0655694  normal  0.111545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48750  hypothetical protein  31.69 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000274485 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1143  OsmC family protein  28.68 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000523467  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1930  OsmC family protein  34.19 
 
 
407 aa  64.3  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0969  OsmC family protein  29.55 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.298439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2142  OsmC family protein  29.58 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4769  OsmC family protein  32 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00807264  hitchhiker  0.00049584 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0039  OsmC-like protein  29.1 
 
 
179 aa  63.5  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3633  OsmC-like protein  33.33 
 
 
406 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0897  OsmC family protein  29.03 
 
 
145 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.669017  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2280  OsmC-like protein  30.53 
 
 
406 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2694  OsmC-like protein  31.34 
 
 
406 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3793  OsmC family protein  29.24 
 
 
185 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.242728 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3145  redox protein regulator of disulfide bond formation, OsmC-like  32.48 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0304  hypothetical protein  32.14 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3231  OsmC family protein  25.64 
 
 
163 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0781  OsmC family protein  27.81 
 
 
169 aa  61.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764307  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1628  OsmC-like protein  39.53 
 
 
138 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0181271 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3867  OsmC family protein  32.79 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0319528 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0623  hypothetical protein  30.65 
 
 
176 aa  61.2  0.000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0005983  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1477  OsmC family protein  30.88 
 
 
137 aa  61.2  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1904  OsmC family protein  24.44 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.576095  unclonable  0.00000937306 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13840  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.98 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3007  OsmC family protein  29.1 
 
 
146 aa  60.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4048  OsmC family protein  29.46 
 
 
415 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000134708  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2794  OsmC family protein  29.85 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0377  OsmC family protein  31.37 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0867  OsmC family protein  31.37 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376239  hitchhiker  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1923  OsmC-like protein  32.03 
 
 
127 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  34.71 
 
 
409 aa  59.3  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3848  OsmC family protein  29.51 
 
 
181 aa  58.9  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.323457  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3495  hypothetical protein  27.94 
 
 
142 aa  58.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0693  OsmC-like protein  27.93 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0330  OsmC family protein  30.39 
 
 
169 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.514624  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0407  OsmC family protein  30.39 
 
 
169 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0496053  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2189  OsmC family protein  32.35 
 
 
169 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0335227  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2212  OsmC family protein  26.77 
 
 
159 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0982  OsmC family protein  32.5 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2054  OsmC family protein  28.03 
 
 
164 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1673  OsmC-like protein  30.23 
 
 
409 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3655  OsmC family protein  27.39 
 
 
410 aa  57  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1917  OsmC family protein  31.3 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591016  normal  0.655521 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2855  OsmC family protein  28.47 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000502537  normal  0.0640135 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0206  OsmC family protein  34.11 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.338673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>