More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3508 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3508  pentapeptide repeat protein  100 
 
 
900 aa  1813    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.432343 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  29.77 
 
 
961 aa  375  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3106  pentapeptide repeat protein  28.63 
 
 
978 aa  240  8e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0745  pentapeptide repeat protein  25.23 
 
 
971 aa  169  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.888113  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  28 
 
 
1033 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1478  pentapeptide repeat-containing protein  33.04 
 
 
263 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  31.3 
 
 
295 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  25.94 
 
 
973 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  45.64 
 
 
903 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5010  pentapeptide repeat protein  50.71 
 
 
204 aa  104  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  45.28 
 
 
384 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0537  pentapeptide repeat-containing protein  23.49 
 
 
959 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.884465  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  43.54 
 
 
234 aa  101  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  45.45 
 
 
286 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  50.43 
 
 
745 aa  100  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  52.17 
 
 
225 aa  99  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 
567 aa  98.6  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  45.83 
 
 
381 aa  97.8  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  47.18 
 
 
521 aa  97.8  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  40.99 
 
 
245 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  43.23 
 
 
340 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  49.6 
 
 
214 aa  95.5  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  47.86 
 
 
401 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2355  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 
234 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.390943  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4336  pentapeptide repeat-containing protein  43.33 
 
 
187 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.789922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2304  pentapeptide repeat protein  47.83 
 
 
234 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  47.86 
 
 
401 aa  95.5  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  49.59 
 
 
182 aa  94  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  51.69 
 
 
449 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  48.76 
 
 
493 aa  94  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1228  hypothetical protein  43.1 
 
 
168 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00146717  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  47.22 
 
 
446 aa  92.4  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  44.85 
 
 
174 aa  91.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5268  pentapeptide repeat protein  48.33 
 
 
180 aa  91.3  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.155872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  44.7 
 
 
319 aa  91.3  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  47.24 
 
 
213 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  45.86 
 
 
184 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  37.65 
 
 
294 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  42.95 
 
 
332 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0129  pentapeptide repeat-containing protein  52.34 
 
 
182 aa  89  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0545  pentapeptide repeat protein  43.08 
 
 
315 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  46.92 
 
 
351 aa  88.2  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  46.4 
 
 
184 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  48 
 
 
309 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  51.28 
 
 
336 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  51.28 
 
 
336 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  46.22 
 
 
225 aa  87.8  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
489 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2302  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
294 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000172848 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3860  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 
176 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0192  pentapeptide repeat-containing protein  48.11 
 
 
181 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4093  pentapeptide repeat-containing protein  44.53 
 
 
143 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.864447  normal  0.810345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4964  pentapeptide repeat-containing protein  43.07 
 
 
250 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  45.54 
 
 
241 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  46.77 
 
 
517 aa  86.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3909  pentapeptide repeat protein  47.06 
 
 
176 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  44 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.82 
 
 
263 aa  85.9  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  48.45 
 
 
448 aa  85.9  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  52.78 
 
 
216 aa  85.9  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  42.22 
 
 
447 aa  85.5  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  48.6 
 
 
168 aa  85.9  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  47.5 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  43.14 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1101  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.233606  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  44.62 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3383  pentapeptide repeat protein  50 
 
 
179 aa  84.7  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.438267  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.8 
 
 
525 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  45 
 
 
311 aa  82.8  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0580  pentapeptide repeat-containing protein  50 
 
 
194 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  44.72 
 
 
260 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  43.7 
 
 
267 aa  82.8  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  43.65 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  40.91 
 
 
199 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0562  pentapeptide repeat protein  41.54 
 
 
315 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  40.87 
 
 
734 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  44.35 
 
 
199 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  47.83 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  50.45 
 
 
264 aa  82.4  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  45.63 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  36.57 
 
 
450 aa  82  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  36.75 
 
 
278 aa  82  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  54.17 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  42.4 
 
 
320 aa  82  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4786  pentapeptide repeat protein  50.52 
 
 
824 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3546  pentapeptide repeat-containing protein  46.09 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000394958  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  46.55 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  39.66 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  43.22 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 
219 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 
343 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  36.2 
 
 
447 aa  80.5  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  51.49 
 
 
156 aa  80.5  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  35.16 
 
 
162 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  37.27 
 
 
343 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  50.93 
 
 
146 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  42.97 
 
 
175 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  40.88 
 
 
227 aa  80.5  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4249  pentapeptide repeat-containing protein  40.91 
 
 
131 aa  80.9  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>