25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3453 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3453  Spore coat protein CotH  100 
 
 
798 aa  1624    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0950404  normal  0.13091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  24.28 
 
 
564 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2048  Spore coat protein CotH  22.46 
 
 
361 aa  53.9  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000159417  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  23.02 
 
 
611 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13610  predicted protein  27.12 
 
 
208 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  25.52 
 
 
485 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  23.43 
 
 
610 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  31.37 
 
 
400 aa  47.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  34.38 
 
 
679 aa  47.8  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  27.36 
 
 
819 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  30.47 
 
 
654 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4920  Spore coat assembly protein-like protein  21.72 
 
 
544 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  23.08 
 
 
533 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0340  N-terminal methylation motif domain protein  25.97 
 
 
567 aa  46.6  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  24.19 
 
 
536 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  19.71 
 
 
358 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2160  hypothetical protein  26.67 
 
 
797 aa  45.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  25 
 
 
538 aa  45.4  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  19.71 
 
 
358 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  19.71 
 
 
358 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  19.71 
 
 
368 aa  45.4  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  19.71 
 
 
368 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0569  hypothetical protein  31.58 
 
 
508 aa  44.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  19.34 
 
 
358 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  19.71 
 
 
358 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>