More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3394 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 808 aa  1610    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  39.44 
 
 		 841 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  40.23 
 
 		 773 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  39.44 
 
 		 802 aa  526  1e-148  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  39.77 
 
 		 862 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 818 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  38.74 
 
 		 804 aa  519  1e-146  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 		 797 aa  510  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  38.52 
 
 		 818 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 827 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 		 829 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  38.34 
 
 		 796 aa  505  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 		 807 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  39.16 
 
 		 778 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.88 
 
 		 807 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  38.63 
 
 		 807 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  37.91 
 
 		 831 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.48 
 
 		 795 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 852 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 819 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  37.4 
 
 		 838 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  38.45 
 
 		 852 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  38.45 
 
 		 852 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  38.51 
 
 		 852 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 835 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  35.54 
 
 		 819 aa  452  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  35.42 
 
 		 819 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  36.01 
 
 		 830 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 817 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  35.84 
 
 		 831 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  35.97 
 
 		 843 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  36.03 
 
 		 832 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  37.32 
 
 		 830 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  34.03 
 
 		 794 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  33.79 
 
 		 794 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 793 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  36.25 
 
 		 830 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  36.39 
 
 		 793 aa  442  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  36.13 
 
 		 809 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 804 aa  439  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  35.74 
 
 		 823 aa  437  1e-121  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 		 819 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  33.69 
 
 		 814 aa  439  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 		 830 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 805 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.73 
 
 		 796 aa  430  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 793 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  36.46 
 
 		 777 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  35.55 
 
 		 818 aa  432  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 808 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  35.39 
 
 		 804 aa  432  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 800 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 857 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  35.44 
 
 		 805 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  36.56 
 
 		 791 aa  429  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  35 
 
 		 803 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  34.38 
 
 		 848 aa  425  1e-117  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.67 
 
 		 804 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 766 aa  424  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  34.03 
 
 		 748 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 		 833 aa  423  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  35 
 
 		 833 aa  422  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  36.16 
 
 		 849 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  36.29 
 
 		 849 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  35.27 
 
 		 790 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  35 
 
 		 805 aa  422  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  34.95 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  32.49 
 
 		 814 aa  417  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  35.29 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  35.54 
 
 		 840 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  34.95 
 
 		 817 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  35.08 
 
 		 817 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  33.5 
 
 		 814 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 814 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 849 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  32.65 
 
 		 815 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  35.54 
 
 		 790 aa  416  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 817 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  35.36 
 
 		 804 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 		 792 aa  415  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  34.67 
 
 		 845 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  33.8 
 
 		 819 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  34.9 
 
 		 803 aa  415  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 796 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  34.64 
 
 		 812 aa  412  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  35.72 
 
 		 801 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 817 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  35.77 
 
 		 797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 803 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  35.73 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.22 
 
 		 823 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  37.04 
 
 		 791 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.11 
 
 		 823 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  36 
 
 		 908 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  33.37 
 
 		 846 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  34.82 
 
 		 839 aa  403  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  35.6 
 
 		 779 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>