More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3345 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3345  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
417 aa  855  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.254717  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5417  cyclic nucleotide-binding protein  47.72 
 
 
419 aa  416  1e-115  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0881735  normal  0.0681678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  35.87 
 
 
435 aa  283  6e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5885  protein serine/threonine phosphatase  42.25 
 
 
259 aa  189  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.75 
 
 
247 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  39.13 
 
 
386 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6845  cyclic nucleotide-binding protein  33.66 
 
 
396 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.8 
 
 
237 aa  172  7e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  40.56 
 
 
238 aa  169  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0733  serine/threonine phosphatase  40.65 
 
 
264 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.310547  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  37.65 
 
 
273 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  39.84 
 
 
415 aa  164  2e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  38.8 
 
 
254 aa  163  4e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1226  serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
236 aa  163  5e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  39.15 
 
 
267 aa  161  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  40.49 
 
 
276 aa  160  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
280 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  38.43 
 
 
236 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0770  protein serine/threonine phosphatase  39.02 
 
 
280 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  35.32 
 
 
245 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  1.79403e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0777  protein phosphatase 2C-like protein  41.18 
 
 
292 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341218  normal  0.437484 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.08 
 
 
236 aa  155  9e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  38.1 
 
 
241 aa  155  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.57 
 
 
257 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  40.7 
 
 
256 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.43 
 
 
261 aa  155  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  37.76 
 
 
395 aa  154  3e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4678  protein serine/threonine phosphatases  35.55 
 
 
261 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  37.21 
 
 
449 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
245 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  34.92 
 
 
452 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  40.86 
 
 
256 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  35.48 
 
 
258 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  35.47 
 
 
252 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 
394 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.31 
 
 
256 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  40.31 
 
 
256 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  35.45 
 
 
256 aa  150  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
241 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  35.63 
 
 
264 aa  149  1e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  36.25 
 
 
269 aa  149  1e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.95 
 
 
320 aa  149  1e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  35.6 
 
 
243 aa  148  2e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36 
 
 
242 aa  148  2e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.29 
 
 
470 aa  148  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  34.92 
 
 
261 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5417  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  38.46 
 
 
242 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.35 
 
 
238 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
244 aa  147  4e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  40.74 
 
 
416 aa  146  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 
256 aa  146  7e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.11 
 
 
319 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  38.98 
 
 
597 aa  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  35.8 
 
 
256 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  32.4 
 
 
240 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 
241 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.01 
 
 
239 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4652  protein serine/threonine phosphatase  33.8 
 
 
361 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.195598  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0437  protein phosphatase 2C-like  36.59 
 
 
296 aa  144  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.018902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  32.49 
 
 
255 aa  143  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  33.6 
 
 
239 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  37.55 
 
 
425 aa  143  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.18 
 
 
276 aa  143  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  34.1 
 
 
259 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
259 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  2.23411e-06  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0898  protein serine/threonine phosphatase  33.71 
 
 
443 aa  142  1e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.979685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  37.7 
 
 
250 aa  141  2e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  33.46 
 
 
270 aa  142  2e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.27 
 
 
271 aa  141  2e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  34.02 
 
 
252 aa  141  2e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  37.7 
 
 
250 aa  141  2e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  37.65 
 
 
242 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  34.27 
 
 
271 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  36.44 
 
 
250 aa  140  4e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.43 
 
 
611 aa  140  4e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  37.65 
 
 
242 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
449 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  37.55 
 
 
250 aa  139  8e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  35.38 
 
 
313 aa  139  9e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3360  protein phosphatase 2C-like  36.59 
 
 
274 aa  139  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  33.73 
 
 
236 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.63 
 
 
250 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5661e-06 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  36.9 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  36.9 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  38.15 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  36.57 
 
 
270 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  36.9 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  36.9 
 
 
250 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1393  phosphoprotein phosphatase  34.84 
 
 
245 aa  138  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0192  protein serine/threonine phosphatase  36.1 
 
 
268 aa  137  3e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  35.98 
 
 
239 aa  137  3e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  37.1 
 
 
250 aa  137  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.45 
 
 
441 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  35.77 
 
 
234 aa  137  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4330  protein serine/threonine phosphatases  36.92 
 
 
280 aa  136  6e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283162  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  35.69 
 
 
469 aa  136  6e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  38.06 
 
 
305 aa  136  7e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  41.5 
 
 
252 aa  136  8e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5576  protein serine/threonine phosphatase  38.15 
 
 
242 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  34.55 
 
 
250 aa  135  1e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>