36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3325 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3325  Protein of unknown function DUF2257  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00674067 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5565  hypothetical protein  43.23 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0125413  normal  0.0140132 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4209  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1096  hypothetical protein  42.62 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.584579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0296  hypothetical protein  27.75 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0358695  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4540  Protein of unknown function DUF2257  30.84 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0273  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0297  hypothetical protein  31.46 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1796  hypothetical protein  31.46 
 
 		 323 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1020  hypothetical protein  31.46 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1710  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1298  hypothetical protein  31.46 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1225  hypothetical protein  30.22 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3525  hypothetical protein  30.04 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.164582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1108  hypothetical protein  28.64 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1813  hypothetical protein  30.9 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.395883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3155  hypothetical protein  30.74 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.622343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1242  hypothetical protein  30.81 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0362517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6125  hypothetical protein  27.87 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0471461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02029  hypothetical protein  28.34 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4860  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000808098  hitchhiker  0.00000198806 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1731  hypothetical protein  28.51 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.809751  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1488  hypothetical protein  28.92 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.303925  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4250  hypothetical protein  25.5 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1928  hypothetical protein  27.63 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2740  hypothetical protein  27.07 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  0.114269 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2754  hypothetical protein  27.07 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2710  hypothetical protein  27.07 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255317  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003743  hypothetical protein  27.67 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.438029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2629  hypothetical protein  25.56 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1370  hypothetical protein  26.67 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2762  hypothetical protein  24.57 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6297  hypothetical protein  22.78 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.385351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3656  hypothetical protein  27.88 
 
 		 250 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0594  hypothetical protein  26.49 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0643  hypothetical protein  30.54 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.60758 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>