More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3321 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 
572 aa  1145    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  34.8 
 
 
528 aa  243  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  30.47 
 
 
556 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  31.33 
 
 
552 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  29.31 
 
 
563 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  46.99 
 
 
520 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  42.96 
 
 
513 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.18 
 
 
523 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.18 
 
 
516 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  28.49 
 
 
559 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  29.58 
 
 
584 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  48.36 
 
 
467 aa  193  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.24 
 
 
516 aa  192  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.63 
 
 
510 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  38.93 
 
 
517 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.2 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  40.22 
 
 
532 aa  184  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  38.02 
 
 
470 aa  181  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.76 
 
 
568 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  38.36 
 
 
521 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  41.06 
 
 
465 aa  177  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.73 
 
 
540 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.26 
 
 
533 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  42.41 
 
 
521 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.85 
 
 
518 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  39.1 
 
 
527 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  26.9 
 
 
459 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  27.04 
 
 
459 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  36.33 
 
 
525 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  36.33 
 
 
525 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  36.33 
 
 
525 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1773  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.77 
 
 
457 aa  152  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  27.17 
 
 
554 aa  152  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  42.86 
 
 
520 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  35.69 
 
 
529 aa  150  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2428  FAD linked oxidase domain protein  30.28 
 
 
455 aa  150  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  39.78 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1963  FAD linked oxidase-like  28.99 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.451792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  37.41 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  36.94 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  37.92 
 
 
586 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  34.98 
 
 
583 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  41.91 
 
 
550 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  37.55 
 
 
527 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  36.51 
 
 
531 aa  147  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  37.45 
 
 
545 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.08 
 
 
579 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  25.18 
 
 
554 aa  145  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  31.25 
 
 
461 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.27 
 
 
565 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1997  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.25 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1862  FAD linked oxidase domain protein  26.06 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.19 
 
 
457 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  32.95 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3774  putative oxidoreductase  38.33 
 
 
499 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0098375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0540  FAD linked oxidase domain protein  38.36 
 
 
470 aa  140  7e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.299448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  34.98 
 
 
471 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1013  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.33 
 
 
466 aa  140  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0095  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.57 
 
 
474 aa  140  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0988  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.55 
 
 
475 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0857891  hitchhiker  0.00240363 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0040  Fis family transcriptional regulator  38.12 
 
 
474 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.19101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  35 
 
 
479 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1975  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.4 
 
 
473 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 
534 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2684  FAD linked oxidase domain protein  26.7 
 
 
480 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.907385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2787  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  35.81 
 
 
476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2900  FAD linked oxidase domain protein  36.16 
 
 
472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  36.61 
 
 
472 aa  137  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3159  FAD linked oxidase domain protein  31.46 
 
 
454 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  34.47 
 
 
471 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1477  FAD linked oxidase-like  36.45 
 
 
474 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0640821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  35.43 
 
 
538 aa  137  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0061  FAD linked oxidase domain protein  37.67 
 
 
474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1612  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.82 
 
 
890 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00746947  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0562  FAD linked oxidase domain protein  34.09 
 
 
466 aa  136  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0064  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.89 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  36.68 
 
 
495 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.83 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2651  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.98 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0846115 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  32.58 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.63 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0250  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.35 
 
 
460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2513  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.98 
 
 
485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  31.85 
 
 
484 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.8 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  36.61 
 
 
472 aa  135  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  30.31 
 
 
470 aa  134  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.31 
 
 
470 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0777  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.52 
 
 
482 aa  134  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  29.92 
 
 
470 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  29.92 
 
 
470 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4518  FAD linked oxidase domain protein  24.05 
 
 
462 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  29.92 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  29.92 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.31 
 
 
470 aa  133  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0268  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  37.05 
 
 
462 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.843143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  35 
 
 
531 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>