More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3318 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1403 aa  2807    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 
1402 aa  795    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  32.4 
 
 
1398 aa  549  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
1311 aa  465  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  32.7 
 
 
1048 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
1349 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
1342 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.68 
 
 
1122 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
1349 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 
1349 aa  425  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 
1348 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  31.63 
 
 
1359 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  31.23 
 
 
1359 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  31.31 
 
 
1359 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  30.65 
 
 
1353 aa  406  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  31.18 
 
 
1359 aa  406  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  31.18 
 
 
1350 aa  406  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  31.18 
 
 
1359 aa  406  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.01 
 
 
1105 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  32.75 
 
 
956 aa  358  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  30.6 
 
 
1213 aa  350  8e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  36.03 
 
 
1227 aa  346  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  29.19 
 
 
1358 aa  336  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.24 
 
 
1151 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
1151 aa  331  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.43 
 
 
1149 aa  326  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1139 aa  323  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  28.54 
 
 
1148 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.43 
 
 
1141 aa  306  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
1138 aa  301  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.8 
 
 
1175 aa  296  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  29.11 
 
 
1037 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.28 
 
 
1043 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 
1046 aa  267  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  29.25 
 
 
1065 aa  258  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  26.83 
 
 
1055 aa  257  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.3 
 
 
1117 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  47.59 
 
 
1818 aa  256  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  28.27 
 
 
1377 aa  249  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  27.94 
 
 
1093 aa  228  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  30 
 
 
1027 aa  211  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.68 
 
 
1134 aa  209  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
1027 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
1027 aa  204  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.99 
 
 
1160 aa  201  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.39 
 
 
1429 aa  198  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.44 
 
 
1422 aa  198  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.18 
 
 
1089 aa  191  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27 
 
 
1023 aa  191  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.59 
 
 
1291 aa  189  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.28 
 
 
1087 aa  183  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.73 
 
 
1081 aa  179  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.46 
 
 
1080 aa  178  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  25.45 
 
 
1133 aa  177  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.19 
 
 
1360 aa  175  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.28 
 
 
1055 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  28.98 
 
 
1063 aa  171  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.88 
 
 
1403 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4959  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  34.06 
 
 
1044 aa  164  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.89 
 
 
1271 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.32 
 
 
676 aa  164  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.33 
 
 
667 aa  164  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3624  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
552 aa  162  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401978  decreased coverage  0.000211559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
1050 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.66 
 
 
1050 aa  160  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  25.11 
 
 
1094 aa  159  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4395  serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
465 aa  159  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  25.08 
 
 
1142 aa  159  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 
700 aa  158  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  37.11 
 
 
625 aa  158  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  36.73 
 
 
667 aa  158  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  36.47 
 
 
615 aa  158  8e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
651 aa  157  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3163  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
761 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.923539  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 
651 aa  156  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  26.95 
 
 
1067 aa  156  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
582 aa  155  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  37.28 
 
 
596 aa  155  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5516  serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 
512 aa  154  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.262851  normal  0.599015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.24 
 
 
627 aa  154  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0021  serine/threonine protein kinase  40.17 
 
 
581 aa  154  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813832 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0036  serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 
614 aa  154  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  40.91 
 
 
666 aa  154  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  37.7 
 
 
623 aa  153  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1383  serine/threonine protein kinase  37.25 
 
 
690 aa  152  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.149944  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
625 aa  152  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.25 
 
 
681 aa  153  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0133  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
590 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  33.93 
 
 
707 aa  152  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0061  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.55 
 
 
562 aa  152  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.34 
 
 
603 aa  152  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
678 aa  152  5e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0115  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
588 aa  152  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  35.76 
 
 
636 aa  151  7e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
1289 aa  151  8e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.96 
 
 
664 aa  150  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  34.15 
 
 
692 aa  150  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3676  serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 
501 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.779668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  37.14 
 
 
692 aa  149  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3114  protein kinase  37.75 
 
 
565 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.419333  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>