More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3269 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3269  Phosphoglycerate kinase  100 
 
 
397 aa  789    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.891729  decreased coverage  0.00998041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2281  phosphoglycerate kinase  58.15 
 
 
396 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306053  normal  0.408831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2424  phosphoglycerate kinase  58.25 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0069746  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1531  phosphoglycerate kinase  58.5 
 
 
396 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.36526  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2336  phosphoglycerate kinase  58.25 
 
 
396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2535  phosphoglycerate kinase  54 
 
 
397 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316768  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2276  phosphoglycerate kinase  53.25 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  52.27 
 
 
650 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4718  Phosphoglycerate kinase  52.25 
 
 
395 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0240  phosphoglycerate kinase  52.63 
 
 
399 aa  396  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0242  phosphoglycerate kinase  52.63 
 
 
399 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2961  phosphoglycerate kinase  50.87 
 
 
394 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00201138  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0263  phosphoglycerate kinase  54.27 
 
 
393 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2542  phosphoglycerate kinase  51.86 
 
 
403 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0741  Phosphoglycerate kinase  52.24 
 
 
395 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3936  Phosphoglycerate kinase  51.63 
 
 
394 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00101338  normal  0.765771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1307  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 
393 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2990  phosphoglycerate kinase  51.99 
 
 
393 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3136  phosphoglycerate kinase  51.87 
 
 
394 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4355  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
400 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2906  phosphoglycerate kinase  53 
 
 
397 aa  387  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4417  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
400 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0167184  normal  0.096059 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1616  Phosphoglycerate kinase  52.51 
 
 
392 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1800  Phosphoglycerate kinase  52.66 
 
 
402 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1332  phosphoglycerate kinase  50.63 
 
 
396 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000015474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0044  phosphoglycerate kinase  52.01 
 
 
397 aa  382  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200914  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1510  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
397 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1300  phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
397 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0133  phosphoglycerate kinase  51.38 
 
 
393 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1131  Phosphoglycerate kinase  48.87 
 
 
396 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0766  Phosphoglycerate kinase  49.75 
 
 
398 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0161542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2734  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 
397 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2059  Phosphoglycerate kinase  53.38 
 
 
395 aa  377  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0612926  normal  0.253988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1116  phosphoglycerate kinase  50.25 
 
 
402 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.206718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1584  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
401 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0148993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.62 
 
 
646 aa  376  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2123  phosphoglycerate kinase  52.88 
 
 
397 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.357501  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1556  Phosphoglycerate kinase  48 
 
 
399 aa  369  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000537872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4988  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000425846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4817  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5700  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 
394 aa  371  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000179008  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3681  phosphoglycerate kinase  48.13 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5367  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000897427  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5252  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 
394 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00039947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2018  phosphoglycerate kinase  49.12 
 
 
394 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2060  phosphoglycerate kinase  48.11 
 
 
397 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4930  phosphoglycerate kinase  47.41 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00046923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5223  phosphoglycerate kinase  47.65 
 
 
394 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5241  phosphoglycerate kinase  47.13 
 
 
394 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0119788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4827  phosphoglycerate kinase  47.16 
 
 
394 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000243166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5287  phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 
394 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000283752  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  48.88 
 
 
655 aa  365  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1947  phosphoglycerate kinase  47.62 
 
 
398 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194449  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3376  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
398 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0642  phosphoglycerate kinase  50.49 
 
 
400 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02241  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 
402 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2875  phosphoglycerate kinase  48.61 
 
 
397 aa  364  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000618078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1473  phosphoglycerate kinase  51.12 
 
 
395 aa  364  1e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00799281  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1418  Phosphoglycerate kinase  49.5 
 
 
403 aa  365  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1886  phosphoglycerate kinase  48.37 
 
 
396 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0022646  normal  0.565163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2060  phosphoglycerate kinase  46.87 
 
 
399 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00601858  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2143  phosphoglycerate kinase  49.26 
 
 
401 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15820  Phosphoglycerate kinase  49.87 
 
 
394 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6037  Phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 
395 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0739  phosphoglycerate kinase  48.62 
 
 
400 aa  361  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000081291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1265  phosphoglycerate kinase  48.74 
 
 
402 aa  361  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.65973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02131  phosphoglycerate kinase  46.9 
 
 
402 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0197  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
402 aa  360  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.868475  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2070  phosphoglycerate kinase  50.74 
 
 
395 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4275  phosphoglycerate kinase  49.38 
 
 
400 aa  359  4e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.487807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0772  phosphoglycerate kinase  50.13 
 
 
400 aa  359  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.608835  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27971  phosphoglycerate kinase  48.76 
 
 
401 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02131  phosphoglycerate kinase  46.88 
 
 
402 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0158378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0138  phosphoglycerate kinase  47.75 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0810442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  47.7 
 
 
654 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2515  phosphoglycerate kinase  50.75 
 
 
397 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0273  phosphoglycerate kinase  47.36 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.632578  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0422  Phosphoglycerate kinase  47.61 
 
 
399 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.052371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0958  phosphoglycerate kinase  48.04 
 
 
406 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0418807  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02151  phosphoglycerate kinase  46.63 
 
 
402 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.772299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4845  phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
394 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2459  phosphoglycerate kinase  47.64 
 
 
401 aa  353  2e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0944  Phosphoglycerate kinase  50.38 
 
 
395 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5607  phosphoglycerate kinase  48.02 
 
 
397 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0914  Phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 
389 aa  352  7e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1617  phosphoglycerate kinase  46.48 
 
 
397 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0893272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1992  phosphoglycerate kinase  50 
 
 
395 aa  351  1e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.771555  normal  0.436943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1694  phosphoglycerate kinase  44.97 
 
 
399 aa  351  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0476729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1883  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 
399 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2337  phosphoglycerate kinase  46.12 
 
 
399 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00547596  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1562  phosphoglycerate kinase  46.4 
 
 
401 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1430  Phosphoglycerate kinase  47.38 
 
 
398 aa  348  1e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.96706  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1778  Phosphoglycerate kinase  48.99 
 
 
394 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.991456  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02711  phosphoglycerate kinase  46.15 
 
 
401 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.542851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0879  Phosphoglycerate kinase  45.57 
 
 
393 aa  347  2e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.436803  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_46028  predicted protein  44.97 
 
 
435 aa  346  4e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.268797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2004  phosphoglycerate kinase  50.62 
 
 
392 aa  345  7e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374925  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1134  phosphoglycerate kinase  49.25 
 
 
389 aa  344  1e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0148781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0616  phosphoglycerate kinase  46.23 
 
 
399 aa  343  2e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.160418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0303  phosphoglycerate kinase  49 
 
 
393 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>